果蝇巨噬细胞DNA损伤信号在氧化应激下调节全身细胞因子水平

该数据集来自 search.dataone.org,主题为果蝇巨噬细胞在氧化应激下的DNA损伤信号与全身细胞因子水平调控

dataone
浏览 8
时间序列分类General Immunology and MicrobiologyDrosophila melanogasterMacrophagesOxidative stressHemocytesGeneral NeuroscienceGeneral BiochemistryGeneral MedicineGenetics and Molecular Biology
DNA damage signaling in Drosophila macrophages modulates systemic cytokine levels in response to oxidative stress

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

果蝇巨噬细胞DNA损伤信号在氧化应激下调节全身细胞因子水平

DNA damage signaling in Drosophila macrophages modulates systemic cytokine levels in response to oxidative stress

该数据集来自 search.dataone.org,主题为果蝇巨噬细胞在氧化应激下的DNA损伤信号与全身细胞因子水平调控。研究利用高通量单核RNA测序,探索成年果蝇在氧化应激条件下血细胞及其他细胞类型(如脂肪体)的变化,鉴定出浆细胞(果蝇巨噬细胞)中与免疫相关的不同细胞响应状态。数据覆盖果蝇免疫、氧化应激、血细胞分化等方向,可用于研究应激响应信号通路、细胞异质性及免疫代谢调控机制(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):环境因素、感染或损伤可在多种组织中引起氧化应激并导致组织稳态丧失。从无脊椎动物到哺乳动物保守的有效应激反应级联可确保重建稳态和组织修复。血细胞,即果蝇的类血细胞,通过免疫激活迅速响应氧化应激。然而,它们如何感知氧化应激并整合这些信号以调节和平衡成年果蝇对氧化应激的反应,其精确信号尚不明确。此外,血细胞多样化尚未在氧化应激条件下得到探索。在这里,我们采用高通量单核RNA测序来探索成年果蝇在氧化应激期间的血细胞和其他细胞类型,如脂肪体。我们在浆细胞,即果蝇巨噬细胞中,鉴定出与免疫相关的不同细胞响应状态。

【主题与分类】

主题标签:General Immunology and Microbiology、Drosophila melanogaster、Macrophages、Oxidative stress、Hemocytes、General Neuroscience、General Biochemistry、General Medicine、Genetics and Molecular Biology。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A10f85b8a403885aa4e0ee3e761594a37eb2b9fd968adfeacba4092fe9eaac48c

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A10f85b8a403885aa4e0ee3e761594a37eb2b9fd968adfeacba4092fe9eaac48c

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

环境因素、感染或损伤可在多种组织中引起氧化应激并导致组织稳态丧失。从无脊椎动物到哺乳动物保守存在的有效应激反应级联,可确保稳态重建和组织修复。血细胞,即果蝇的类血细胞,通过免疫激活迅速响应氧化应激。然而,它们如何感知氧化应激并整合这些信号以调节和平衡成年果蝇对氧化应激的反应,其精确信号尚不明确。此外,尚未在氧化应激条件下探索血细胞的多样化。在此,我们采用高通量单核RNA测序技术,探索成年果蝇在氧化应激期间的血细胞及其他细胞类型,如脂肪体。我们鉴定出浆细胞(果蝇巨噬细胞)中与免疫反应和代谢激活相关的不同细胞响应状态。我们进一步定义了氧化应激诱导的……,黑腹果蝇品系:果蝇饲养于含10%啤酒酵母、8%果糖、2%玉米糊和0.8%琼脂的高酵母食物上。

为防止细菌或真菌生长,加入了丙酸和尼泊金甲酯。所有杂交(除含tub-Gal80ts构建体或另有说明者外)均在25°C、12小时暗/光周期下进行。含tub-Gal80ts的杂交在18°C下进行,以确保在果蝇发育阶段抑制Gal4蛋白。实验用雄性F1果蝇一孵化即转移至29°C,并培养六天。本研究使用的所有转基因品系列于下方:本研究使用的果蝇品系列表 来源 w1118;HmlΔ-Gal4,UAS-2xeGFP 由Marc S. Dionne赠送 w1118;UAS-tefu-IR 维也纳果蝇研究中心 w1118;UAS-mei41-IR 维也纳果蝇研究中心 w1118;UAS-nbs-IR 维也纳果蝇研究中心 w1118;UAS-mei41-IR;UAS-tefu-IR 为本研究制作 w1118;UAS-…,

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案