自闭症与典型发育男孩血浆和尿液代谢谱比较初步研究
该数据集来源于 omicsdi.org,对应一项比较自闭症男孩与典型发育男孩血浆和尿液代谢谱的初步研究。研究纳入 30 名自闭症男孩和 30 名年龄严格匹配的健康对照男孩(年龄范围 2.4~6.7 岁),采集晨尿和血浆样本,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)获取非靶向代谢谱,并通过多变量分析筛选差

基本信息
资源简介
自闭症与典型发育男孩血浆和尿液代谢谱比较初步研究
该数据集对应一项比较自闭症男孩与典型发育男孩血浆和尿液代谢谱的初步研究,来源于 omicsdi.org,主题标签为代谢组学(Metabolomics),在本站归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 其他。研究围绕自闭症谱系障碍儿童除核心行为症状外可能存在的代谢异常展开,旨在对同一队列自闭症男孩的晨尿与血浆样本进行综合代谢谱分析。研究纳入 30 名自闭症男孩和 30 名年龄严格匹配的健康对照男孩,年龄范围为 2.4~6.7 岁,采集晨尿和血浆样本,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)获取非靶向代谢谱,所得数据经多变量分析处理,并将筛选出的差异代谢物按代谢通路进行分组。该数据集为初步研究性质,适合作为自闭症相关代谢组学研究的参考数据资源。
【数据集背景】
自闭症谱系障碍被定义为一种广泛性发育障碍,由遗传和环境风险因素引起。除核心行为症状外,已有积累的研究结果表明,自闭症儿童还伴有一些代谢异常。该研究的目标是分析来自同一自闭症男孩队列的晨尿和血浆样本的综合代谢谱,以从代谢层面刻画自闭症男孩与典型发育男孩之间的差异。研究设计为初步研究,聚焦于同一批受试者的两种生物样本类型,以便在血浆与尿液之间进行代谢谱的比较。
【数据内容】
数据集的核心内容是自闭症男孩与典型发育男孩在血浆和尿液样本中的代谢谱数据。研究采集了晨尿和血浆两类样本,并采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术获取非靶向代谢谱。所得数据经过多变量分析处理,筛选出具有判别能力的差异代谢物,并进一步按代谢通路对筛选出的代谢物进行分组。数据集的主题标签为代谢组学。关于数据文件的具体格式、样本数量之外的记录条目、代谢物数量及通路数量等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。研究招募了 30 名自闭症男孩和 30 名年龄严格匹配的健康对照男孩,年龄范围为 2.4~6.7 岁。样本类型为晨尿和血浆,且两类样本来自同一队列受试者。检测平台为液相色谱-质谱联用(LC-MS),用于获取非靶向代谢谱。关于样本采集的具体时间地点、机构信息、伦理审批信息及原始数据存放位置等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于代谢组学相关的研究与分析场景,尤其是围绕自闭症谱系障碍儿童代谢特征比较的初步探索。由于同时包含血浆与尿液两类样本的非靶向代谢谱,可用于比较不同生物样本类型在代谢谱判别中的表现,也可用于差异代谢物的筛选及代谢通路层面的归纳分析。此外,该数据集可作为自闭症代谢异常研究的参考数据,供方法学比较、初步假设生成或后续验证性研究设计时参考。关于具体的分析软件、统计模型参数及验证结果,源站未提供。
【使用方法】
依据源站描述,数据获取后通过多变量分析进行处理,并在此基础上筛选差异代谢物,再将筛选出的代谢物按代谢通路分组。使用者可参照这一分析流程,对非靶向代谢谱数据进行多变量分析与通路归类。关于数据下载方式、文件组织方式、预处理步骤、参数设置及代码等具体使用说明,源站未提供。
【质量与限制】
该研究为初步研究,受试者规模为 30 名自闭症男孩与 30 名年龄严格匹配的健康对照男孩,年龄范围为 2.4~6.7 岁,样本类型为晨尿和血浆,检测方法为 LC-MS 非靶向代谢谱。研究结论基于多变量分析与差异代谢物筛选,源站描述中未提供完整的差异代谢物列表与统计细节。关于数据集的缺失值情况、批次效应、重复性验证及外部验证等信息,源站未提供。使用者应注意该研究的初步性质及样本量的局限。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、作者信息、发表期刊、DOI 及许可条款,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS2421
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:自闭症谱系障碍(ASD)被定义为一种广泛性发育障碍,由遗传和环境风险因素引起。除核心行为症状外,已有累积结果表明ASD儿童还伴有一些代谢异常。目的:分析同一自闭症男孩队列中晨尿和血浆样本的综合代谢谱。方法:本研究招募了30名自闭症男孩和30名严格匹配的健康对照(HC)男孩(年龄范围:2.4~6.7岁)。采集晨尿和血浆样本,并应用液相色谱-质谱联用(LC-MS)获取非靶向代谢谱。所得数据经多变量分析处理,筛选出的代谢物按代谢途径分组。结果:在血浆和尿液样本中发现了不同的判别代谢物。值得注意的是,在同一ASD儿童队列中,牛磺酸和儿茶酚水平在尿液中降低,但在血浆中升高。
富集通路分析显示,在血浆和尿液样本中均可发现牛磺酸与亚牛磺酸代谢、苯丙氨酸代谢以及精氨酸与脯氨酸代谢的扰动。结论:这些初步结果表明,ASD儿童中存在一系列共同的代谢扰动,并证实了对不同生物样本中的代谢物进行全面分析以揭示ASD相关复杂代谢模式全貌的重要性。仍需进一步的靶向分析在更大队列中验证这些结果。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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