慢性肾衰竭患者贫血相关的粪便微生物与代谢改变

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS12576

标准获取流程：

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数据说明

肠道微生物组与肾脏进行交流，并可能在慢性肾衰竭（CRF）患者贫血的发生发展中发挥关键作用。然而，微生物群的变化及其与功能性代谢物的关联仍不清楚。我们对30例CRF贫血患者和20名健康对照（HCs）组成的队列进行了宏基因组学和非靶向代谢组学研究，以识别肠道微生物组的特征并探索其与宿主的潜在相互作用。在CRF贫血患者中观察到微生物多样性降低及显著的组成差异。我们鉴定出六种在CRF贫血患者中显著变化的肠道微生物，尤其是Faecalibacterium prausnitzii、Prevotella copri和Escherichia coli，它们与血红蛋白（Hb）水平和估算肾小球滤过率密切相关。这些变化伴随着独特微生物途径的功能改变。

进一步的粪便和血清代谢组学分析显示，花生四烯酸代谢中的粪便12-KETE-LB4、β-丙氨酸代谢中的尿嘧啶和L-天冬氨酸、抗坏血酸和醛糖酸代谢中的古洛糖酸，伴随前15种差异血清代谢物与血红蛋白水平密切相关。此外，我们观察到CRF贫血相关的肠道微生物物种与特征性代谢物之间存在复杂的共现关系。而且，一个结合Faecalibacterium prausnitzii、Prevotella copri以及粪便12-KETE-LB4、尿嘧啶、L-天冬氨酸和古洛糖酸的非侵入性模型能够区分CRF贫血患者与健康对照（曲线下面积：0.879）。总之，我们的结果表明，与功能性代谢物相关的肠道微生物群失调可能是CRF贫血的非侵入性诊断和治疗靶点。关联研究：本研究报道了血浆样本的UPLC-MS检测。粪便样本的UPLC-MS检测报道于MTBLS6334。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。