粪便宏基因组与血清代谢组改变指示Budd-Chiari综合征患者管理策略

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS2319

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：我们研究了肠道微生物群和血清代谢水平对布加综合征（B-CS）患者的影响，及其对临床管理策略的指导意义。设计：本研究纳入214例B-CS受试者，包括未治疗病例（n=93）和治疗病例（n=121）。采用鸟枪法宏基因组学和液相色谱质谱联用（LC-MS）分析肠道微生物群和血清代谢组。纳入41名对照者。结果：B-CS患者肠道微生物群中弯曲杆菌属丰度较高，而酵母菌属、异常球菌属和硫单胞菌属丰度较低（P < 0.05）。在B-CS患者中鉴定出13种差异代谢物，如牛磺胆酸盐和®−3−羟基丁酸。随机森林（RF）模型显示，血清代谢组能有效区分B-CS患者与健康对照者，RF-代谢组学表现出完美的判别能力（AUC = 100%，95% CI：100% – 100%），显著高于RF-宏基因组学所达到的水平（AUC = 58.48%，95% CI：38.46% – 78.5%）。

关联分析结果显示，在有临床表现的B-CS患者中，简明弯曲杆菌与牛磺胆酸盐呈显著正相关（P < 0.05）。此外，与接受治疗的B-CS患者相比，未经治疗的B-CS患者中放线菌门显著增多（P < 0.05）。与健康对照相比，接受治疗的B-CS患者中弯曲杆菌属和韦荣球菌属显著增多（P < 0.05）。此外，对于无临床表现的患者，治疗组与未治疗组之间发现的差异微生物较少。结论：我们确定了B-CS患者肠道微生物群和血清代谢组的主要变化。粪便宏基因组学和血清代谢组学的变化为Budd-Chiari综合征患者的管理策略提供了指导。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。