多族裔白细胞DNA甲基化与血脂的全表观基因组关联研究

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A87cf207fedbd3426584094db7a40105531e908f4b66828f14cf68ca63db1b0fc

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在一个由16,265名受试者组成的多种族样本中，研究了循环白细胞中DNA甲基化与血脂之间的关联。我们分别在欧洲人、非洲裔美国人和西班牙裔人群中识别出148个、35个和4个新关联，并通过跨种族荟萃分析额外发现了186个新关联。我们观察到不同种族/族裔群体间效应方向高度一致，高密度脂蛋白与甘油三酯的效应量高度相关，与其他心血管代谢性状的全表观基因组关联研究中的关联有适度重叠，而与迄今为止通过全基因组关联研究识别出的脂质位点重叠度较低。有30个CpG位点在至少2个种族/族裔群体中达到显著性，其中7个显示与注释基因的表达相关。注释到CPT1A的CpG位点显示出受甘油三酯水平影响的证据。循环白细胞的DNA甲基化水平显示出稳健的a……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。