GWAS位点对家族性血脂异常的贡献
该数据集是一个基因组数据集,包含来自53个芬兰家族性混合型高脂血症家庭的715名成员的基因型数据,涵盖约九百万个变异,通过分析孟德尔变异和多基因评分,研究GWAS位点对家族性血脂异常的遗传贡献,主要应用于血脂异常遗传机制、多基因风险评分评估及家族性心血管疾病研究方向。
https://figshare.com/articles/dataset/The_Contribution_of_GWAS_Loci_in_Familial_Dyslipidemias/3935553
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资源简介
该数据集聚焦于家族性混合型高脂血症(FCH),一种以总胆固醇和/或甘油三酯水平升高为特征的常见复杂家族性血脂异常,其冠心病风险增加五倍以上。研究旨在探索罕见孟德尔变异和常见变异对FCH易感性的遗传结构及贡献。数据集包含来自53个芬兰FCH家庭的715名家庭成员的基因型数据,涵盖约九百万个变异。通过比较FCH家庭与普通人群样本的等位基因频率,分析了已知与单基因血脂异常和/或普通人群血脂水平相关的变异富集情况。同时,利用212个血脂相关SNP构建加权多基因评分,评估孟德尔变异和多基因评分对家庭中FCH风险的相对贡献。研究发现,在整个等位基因频率谱中,FCH患者中已知升高低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和/或甘油三酯(TG)的变异富集,而降低这些水平的变异缺乏。基于TG相关SNP的评分在受影响个体中尤其高。在234名受影响FCH个体中,3%携带孟德尔变异,35%通过多基因评分超过人群第90百分位显示出已知LDL-C或TG升高变异的高累积。高评分对FCH患者的阳性预测值远高于人群中类似散发病例。该数据集支持FCH具有高度多基因性,表明整个等位基因频率谱的变异共同贡献于这一复杂家族性状,多基因SNP面板有助于识别FCH患者,但其临床效用尚待确定。
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