妊娠期糖尿病OGTT动态多组学图谱:代谢应答受损、脂质结构重塑与环境暴露关联

该数据集整合了妊娠期糖尿病(GDM)孕妇与匹配的正常血糖对照在75 g口服葡萄糖耐量试验(OGTT)期间母体血浆的多组学图谱

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表格分类Clinical medicineBasic medicalInformation science and systems scienceBiologyMathematical statisticsGestational diabetes mellitusOral glucose tolerance testMetabolomicsExposomicsLipidomicsMulti-omics
Dynamic Multi-Omics Profiling during the OGTT Reveals Impaired Metabolic Responses, Lipid Structural Remodeling, and Environmental Exposure Associations in Gestational Diabetes Mellitus

基本信息

模态
表格
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution Non Commercial 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-17
版本
V1

资源简介

妊娠期糖尿病OGTT动态多组学图谱:代谢应答受损、脂质结构重塑与环境暴露关联

Dynamic Multi-Omics Profiling during the OGTT Reveals Impaired Metabolic Responses, Lipid Structural Remodeling, and Environmental Exposure Associations in Gestational Diabetes Mellitus

该数据集整合了妊娠期糖尿病(GDM)孕妇与匹配的正常血糖对照在75 g口服葡萄糖耐量试验(OGTT)期间母体血浆的多组学图谱。血浆在空腹(0 h)、负荷后1 h和2 h采样,采用正负离子模式的非靶向液相色谱-质谱(LC-MS)分析。原始数据包含732个mzXML文件,分为代谢组/暴露组层(374个文件)和独立采集的脂质组层(358个文件)。处理后特征矩阵包括含代谢物名称和KEGG ID的1,322特征代谢组表、258种化学物质的暴露组矩阵和2,207种脂质的脂质组表。该数据可用于研究GDM在OGTT动态过程中的代谢应答、脂质结构重塑及环境暴露关联,支持多组学整合分析与分类建模(来源 DOI 解析,Creative Commons A。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集提供了一个整合的多组学资源,对妊娠期糖尿病(GDM)孕妇和匹配的正常血糖对照在75 g口服葡萄糖耐量试验(OGTT)期间的母体血浆进行了分析。血浆在空腹(0 h)以及葡萄糖负荷后1 h和2 h采样,并采用正负离子模式的非靶向液相色谱-质谱(LC-MS)进行分析。原始数据包含732个mzXML文件,组织为两个分子层:代谢组/暴露组层(374个文件:187个正离子+187个负离子),由两个组学共享;以及独立采集的脂质组层(358个文件:183个正离子+175个负离子)。处理后的特征矩阵包括一个含代谢物名称和KEGG ID的1,322特征代谢组表(omics_metabolome.csv;560个正离子+762个负离子,PQN归一化)、一个258种化学物质的暴露组矩阵(omics_exposome.csv)以及一个2,207种脂质的脂质组表。

【主题与分类】

主题标签:Clinical medicine、Basic medical、Information science and systems science、Biology、Mathematical statistics、Gestational diabetes mellitus、Oral glucose tolerance test、Metabolomics、Exposomics、Lipidomics。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【获取与许可】

源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=c3fdaca5278d4223878d3282f629d98c

使用许可:Creative Commons Attribution Non Commercial 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.44304

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集呈现了一个整合性多组学资源,对妊娠期糖尿病(GDM)孕妇及匹配的正常血糖对照者在75 g口服葡萄糖耐量试验(OGTT)过程中的母体血浆进行了 profiling。血浆于空腹(0 h)及葡萄糖负荷后1 h和2 h采样,并采用非靶向液相色谱-质谱联用(LC-MS)在正离子和负离子两种电离模式下进行分析。原始数据由732个mzXML文件组成,组织为两个分子层:代谢组/暴露组层(374个文件:187个正离子 + 187个负离子),由两个组学共享;以及独立采集的脂质组层(358个文件:183个正离子 + 175个负离子)。处理后特征矩阵包括:一个含1,322个特征的代谢组表,附代谢物名称和KEGG ID(omics_metabolome.csv;560个正离子 + 762个负离子,经PQN归一化);一个258种化学物质的暴露组矩阵(omics_exposome.csv);以及一个含2,207种脂质物种、附类别注释的矩阵(omics_lipidome.csv;159份临床样本)。

每个组学层各有一份样本元数据表(371行),将原始与统一后的mzXML文件名、分组(GDM/对照/QC)、患者标识符、OGTT时间点及组学层相互关联。该队列由84例GDM妊娠和84例健康对照组成,每位受试者最多贡献三个OGTT时间点(共168份临床样本),另加19份混合质控样本。该数据集可支持葡萄糖负荷代谢动力学、GDM病理生理学、妊娠期环境污染物暴露以及整合性多组学生物标志物发现等研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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