多功能GLP-1/C-peptide/L-4F嵌合肽整合血糖控制与脂质重塑

该数据集包含用于“用于同时治疗2型糖尿病和血脂异常的三重嵌合蛋白GLP-1/CP/L-4F的设计与生物学评价”的分子动力学模拟(MDS)数据

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蛋白质预测内分泌营养和代谢疾病糖尿病分子动力学模拟GLP-1嵌合肽2型糖尿病血脂异常
A Multifunctional GLP-1/C-peptide/L-4F Chimeric Peptide Integrates Glycemic Control and Lipid Remodeling

基本信息

模态
蛋白质
大小
1.227498657 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

多功能GLP-1/C-peptide/L-4F嵌合肽整合血糖控制与脂质重塑

本数据集围绕一种用于同时治疗2型糖尿病和血脂异常的三重嵌合蛋白GLP-1/CP/L-4F的设计与生物学评价,提供了相应的分子动力学模拟(MDS)数据。数据集英文名称为“A Multifunctional GLP-1/C-peptide/L-4F Chimeric Peptide Integrates Glycemic Control and Lipid Remodeling”,在站内归入内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病分类,来源站为doi.org,作者为Mariam, Zamara,机构为Zenodo,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。整体而言,该数据集以分子动力学模拟轨迹为核心内容,可用于观察GLP-1、GCL及相关嵌合肽与GLP-1R的相互作用,以及嵌合肽库在水环境中的模拟表现,为糖尿病与血脂异常相关多肽药物的计算研究提供基础数据。

【数据集背景】

该数据集服务于“用于同时治疗2型糖尿病和血脂异常的三重嵌合蛋白GLP-1/CP/L-4F的设计与生物学评价”这一研究主题。其英文名称强调了一种多功能GLP-1/C-peptide/L-4F嵌合肽,旨在整合血糖控制与脂质重塑。数据集聚焦于分子动力学模拟,属于内分泌、营养和代谢疾病尤其是糖尿病相关研究的数据资源。通过提供模拟轨迹文件,该数据集支持对嵌合蛋白与受体相互作用及肽库行为的计算分析。

【数据内容】

数据集包含分子动力学模拟(MDS)数据。每个文件夹均包含来自MDS轨迹的.psf和.xtc文件。具体而言,GLP-1-GLP1R.zip文件夹中为GLP-1与GLP-1R结合的模拟数据;GCL-GLP1R.zip文件夹中为GCL与GLP-1R复合物的模拟数据;Chimeric-library.zip文件夹中则包含其他12种肽与GCL一起在水环境中模拟的数据。这些文件共同构成了该数据集的全部内容。

【采集与来源】

数据集来源站为doi.org,作者为Mariam, Zamara,机构为Zenodo,发布时间为2026年。源站描述指出,该数据集为上述三重嵌合蛋白设计与生物学评价研究提供分子动力学模拟数据。数据以压缩文件夹形式组织,分别对应不同的模拟体系。除源站描述所提及的信息外,源站未提供更详细的采集方法、模拟参数或实验条件。

【适用场景】

该数据集适用于分子动力学模拟相关的计算研究,尤其是针对GLP-1、GCL及嵌合肽与GLP-1R相互作用的研究。可用于分析GLP-1与GLP-1R结合、GCL与GLP-1R复合物以及嵌合肽库在水环境中的模拟轨迹。其站内分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病,因此也可服务于2型糖尿病和血脂异常相关多肽药物设计的计算辅助研究。适用场景不限于上述方向,但源站未提供其他具体应用说明。

【使用方法】

使用者可下载对应的压缩文件夹,解压后获得.psf和.xtc文件。这些文件可用于分子动力学轨迹的可视化、分析或再处理。GLP-1-GLP1R.zip用于GLP-1与GLP-1R结合体系,GCL-GLP1R.zip用于GCL与GLP-1R复合物体系,Chimeric-library.zip用于其他12种肽与GCL在水中的模拟体系。具体分析工具与流程源站未提供,需使用者根据自身研究需求选择。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、模拟时长、力场、温度、压力等具体参数的信息,也未说明数据的完整性、准确性或潜在偏差。因此,使用者在采用该数据集时,应自行评估其适用性。该数据集仅包含分子动力学模拟数据,不包含实验验证数据或临床数据。许可为Creative Commons Attribution 4.0 International,使用时需遵守相应条款。

【引用与许可】

该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名条件下共享与改编。引用时需注明作者Mariam, Zamara、机构Zenodo、发布时间2026年及数据集英文名称。源站未提供具体的引用格式或DOI链接,使用者应参考来源站doi.org获取正式引用信息。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22659472

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.23 GB。

数据说明

本数据集包含“用于同时治疗2型糖尿病和血脂异常的三重嵌合蛋白GLP-1/CP/L-4F的设计与生物学评价”的分子动力学模拟(MDS)数据。每个文件夹均含有来自MDS轨迹的.psf和.xtc文件,具体如下:GLP-1-GLP1R.zip文件夹中为GLP-1与GLP-1R结合的数据;GCL-GLP1R.zip文件夹中为GCL与GLP-1R复合物的数据;Chimeric-library.zip文件夹中则包含了其他12种肽与GCL一同在水环境中模拟的数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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