囊性纤维化患者非结核分枝杆菌感染的分子机制分析数据集
该数据集包含从GEO数据库获取的囊性纤维化患者并发非结核分枝杆菌感染相关的基因表达谱数据，涉及78个关键基因的表达信息。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，研究人员识别出五个枢纽基因并发现它们主要富集于肌动蛋白相关通路，同时揭示了调控这些基因的转录因子网络。该基因表达数据集主要用于探索囊性纤维化合并非结核分枝杆菌感染的分子机制、识别潜在生物标志物和药物治疗靶点，为相关疾病的病理机制研究和精准医疗提供重要数据基础。
基本信息
资源简介
囊性纤维化患者非结核分枝杆菌感染的分子机制分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis》。配套论文《Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis》发表于 Future Microbiology（2024），DOI：10.2217/fmb-2023-0237。项目资助方：This work was supported by the 2020 Natural Science Foundation of Fujian Province (grant number: 2020J011146).。源站首次发布：2024-07-29。
【数据内容】
源站原始描述：Aim: This study aims to explore the molecular mechanisms of cystic fibrosis (CF) complicated with nontuberculous mycobacteria (NTM) infection. Materials & methods: Expression profiles of CF with NTM-infected patients were downloaded from GEO database. Intersection analysis yielded 78 genes associated with CF with NTM infection. The protein–protein interaction (PPI) network and the functions of hub genes were investigated. Results: Five hub genes (PIK3R1, IL1A, CXCR4, ACTN1, PFN1) were identified…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 3.20 MB。Figure S1.TIF：image/tiff，2.41 MB。Figure S2.TIF：image/tiff，785.32 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.26395685.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。主题标签：cystic fibrosis、gene expression omnibus、infection、nontuberculous mycobacteria、transcription factors。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Molecular_mechanism_analysis_of_nontuberculous_mycobacteria_infection_in_patients_with_cystic_fibrosis/26395685
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis. Taylor & Francis. Chen, Qihuang; Li, Jin
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一个用于研究囊性纤维化（CF）患者并发非结核分枝杆菌（NTM）感染分子机制的基因表达谱数据集。数据来源于GEO数据库，包含与CF合并NTM感染相关的78个基因表达信息。研究人员通过蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，识别出五个关键枢纽基因（PIK3R1、IL1A、CXCR4、ACTN1、PFN1），并发现这些基因主要富集于肌动蛋白相关的生物过程和通路。研究还揭示了调控枢纽基因的转录因子网络，其中RELA、JUN、NFKB1和FOS调控IL1A表达，另有21个转录因子调控CXCR4表达。该数据集主要用于探索CF患者并发NTM感染的分子机制、识别潜在生物标志物和治疗靶点，为相关疾病的机制研究和治疗策略开发提供数据支持。
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