病毒感染下固醇生物合成基因新生mRNA合成的测量

该数据集包含病毒感染实验条件下固醇生物合成相关基因的新生mRNA表达谱数据,数据模态为基因表达微阵列数据,通过Affymetrix Gene 1.0 ST平台检测野生型和Tyk2−/−骨髓巨噬细胞感染鼠巨细胞病毒后的转录变化,主要用于研究病毒感染对宿主细胞固醇代谢途径的调控机制,在病毒-宿主相互作用和免疫代谢研究领域具有重要应用价值。

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2016-02-24 更新
浏览 48
type 1 IFNsterol pathwayinterferon family memberssterol biosynthesismetabolite rescue experimentsmodulating lipid metabolismsrebf 2 gene transcriptionSterol Biosynthesis LittleIL 6. Quantitative analysisIFN β treatmentinfectionConditioned media experiments
Measurement of de novo mRNA synthesis of sterol biosynthesis genes upon viral infection

基本信息

大小
0.002244842 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-02-24
版本
v1

资源简介

病毒感染下固醇生物合成基因新生mRNA合成的测量

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Measurement of de novo mRNA synthesis of sterol biosynthesis genes upon viral infection.》。配套论文《Host Defense against Viral Infection Involves Interferon Mediated Down-Regulation of Sterol Biosynthesis》发表于 PLoS Biology(2011),DOI:10.1371/journal.pbio.1000598。源站首次发布:2011-03-08。

【数据内容】

源站原始描述:Wild Type or Tyk2−/− BMDM were infected with mCMV at an MOI of 1 for 1 h. De novo RNA was labeled between 360 and 390 min post-infection, isolated, and hybridized to Affymetrix Gene 1.0 ST microarrays (Materials and Methods). After scanning and data capture, gene expression in mock-infected or infected cells was analyzed, and for the purposes of presentation, gene expression values from control (mock infected) BMDM (black) were adjusted to a value of 1. Values for expression in infected cells (w…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 2.24 MB。Figure 8.tif:image/tiff,2.24 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pbio.1000598.g008。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。主题标签:type 1 IFN、sterol pathway、interferon family members、sterol biosynthesis、metabolite rescue experiments、modulating lipid metabolism、srebf 2 gene transcription、Sterol Biosynthesis Little、IL 6. Quantitative analysis、IFN β treatment。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Measurement_of_de_novo_mRNA_synthesis_of_sterol_biosynthesis_genes_upon_viral_infection_/463986

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Blanc, Mathieu; Yuan Hsieh, Wei; A. Robertson, Kevin; Watterson, Steven; Shui, Guanghou; Lacaze, Paul; et al. (2016). Measurement of de novo mRNA synthesis of sterol biosynthesis genes upon viral infection.. PLOS Biology. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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数据说明

该数据集记录了病毒感染条件下,固醇生物合成相关基因新生mRNA合成的基因表达数据。数据来源于野生型或Tyk2−/−骨髓来源巨噬细胞(BMDM)感染鼠巨细胞病毒(mCMV)的实验,感染后360-390分钟期间标记并分离新生RNA,使用Affymetrix Gene 1.0 ST微阵列进行杂交检测。数据集包含模拟感染和实际感染细胞的基因表达分析结果,主要用于研究病毒感染对宿主细胞固醇代谢途径的转录调控影响,在病毒-宿主相互作用和代谢免疫学领域具有重要研究价值。

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