囊性纤维化患者合并非结核分枝杆菌感染的分子机制分析

该数据集包含囊性纤维化患者合并非结核分枝杆菌感染的基因表达谱数据,属于基因表达模态,通过分析筛选出78个相关基因并构建蛋白质相互作用网络,识别出五个枢纽基因及其调控转录因子,主要用于研究感染机制、肌动蛋白通路在疾病中的作用,为开发治疗策略提供分子基础。

Figshare
2024-07-29 更新
浏览 10
cystic fibrosisgene expression omnibusinfectionnontuberculous mycobacteriatranscription factors
Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis

基本信息

大小
0.003199492 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-07-29
版本
v1

资源简介

囊性纤维化患者合并非结核分枝杆菌感染的分子机制分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis》。配套论文《Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis》发表于 Future Microbiology(2024),DOI:10.2217/fmb-2023-0237。项目资助方:This work was supported by the 2020 Natural Science Foundation of Fujian Province (grant number: 2020J011146).。源站首次发布:2024-07-29。

【数据内容】

源站原始描述:Aim: This study aims to explore the molecular mechanisms of cystic fibrosis (CF) complicated with nontuberculous mycobacteria (NTM) infection. Materials & methods: Expression profiles of CF with NTM-infected patients were downloaded from GEO database. Intersection analysis yielded 78 genes associated with CF with NTM infection. The protein–protein interaction (PPI) network and the functions of hub genes were investigated. Results: Five hub genes (PIK3R1, IL1A, CXCR4, ACTN1, PFN1) were identified…

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 3.20 MB。Figure S1.TIF:image/tiff,2.41 MB。Figure S2.TIF:image/tiff,785.32 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.26395685.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。主题标签:cystic fibrosis、gene expression omnibus、infection、nontuberculous mycobacteria、transcription factors。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Molecular_mechanism_analysis_of_nontuberculous_mycobacteria_infection_in_patients_with_cystic_fibrosis/26395685

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Molecular mechanism analysis of nontuberculous mycobacteria infection in patients with cystic fibrosis. Taylor & Francis. Chen, Qihuang; Li, Jin

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数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/Molecular_mechanism_analysis_of_nontuberculous_mycobacteria_infection_in_patients_with_cystic_fibrosis/26395685

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数据说明

该数据集来源于一项针对囊性纤维化(CF)患者合并非结核分枝杆菌(NTM)感染的分子机制研究。数据包括从GEO数据库下载的感染患者的表达谱,通过交集分析筛选出78个与感染相关的基因,并构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络以鉴定枢纽基因。研究发现了五个关键枢纽基因(PIK3R1、IL1A、CXCR4、ACTN1、PFN1),这些基因主要富集于肌动蛋白相关的生物过程和通路。此外,还识别了调控这些枢纽基因的转录因子,如RELA、JUN、NFKB1和FOS。该数据集主要用于探索CF与NTM感染的分子机制,为疾病治疗提供潜在靶点和研究方向。

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