HPRC 队列 558 单倍型组装 refrel3 v1 归档（对 T2T-CHM13v2.0，q4k 与 q16k）
每个归档可解码回其源 FASTA（XXH3。本站分类：内分泌系统疾病/先天性肾上腺皮质增生症。本数据集为内分泌系统疾病领域公开数据集，由Zenodo提供，主题涵盖genomics。
基本信息
资源简介
HPRC 队列 558 单倍型组装 refrel3 v1 归档（对 T2T-CHM13v2.0，q4k 与 q16k）
HPRC cohort (558 haplotype assemblies) as refrel3 v1 archives against T2T-CHM13v2.0 (q4k and q16k)
该数据集为 Human Pangenome Reference Consortium 的 558 个单倍型组装（year-1 94 个、release 2 464 个），以 refrel3 v1 归档形式针对解码后的 T2T-CHM13v2.0 参考重新编码，提供 q4k（Q = 4096）与 q16k（Q = 16384）两种块大小，均带逐块 XXH3 校验。每个数据集一个 tar，归档位于 tar 根目录，内含 SHA256SUMS，并按 500 MiB 分卷发布；MANIFEST.tsv 给出每个组装的源 URL、HPRC 索引哈希、FASTA XXH3 及两个归档的 SHA-256。每个归档可解码回其源 FASTA（XXH3。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【主题与分类】
主题标签：genomics、pangenome、HPRC、T2T-CHM13、compression、random access、GPU。本站分类：内分泌系统疾病/先天性肾上腺皮质增生症。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23232317
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23232317
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 20.43 GB。
数据说明
人类泛基因组参考联盟的558个单倍型组装（第一年94个，第2版464个）被重新编码为refrel3 v1归档文件，以解码后的T2T-CHM13v2.0参考为基准，采用两种块大小：q4k（Q = 4096，12 330 370 123 B）和q16k（Q = 16384，8 097 986 851 B），两者均带有逐块XXH3。每个数据集一个tar文件（归档文件位于tar根目录，SHA256SUMS在内部），以500 MiB分卷形式发布（cohort558_q4k.tar.part00…23、cohort558_q16k.tar.part00…15；PARTS.sha256 = 每个分卷的SHA-256，cohort558_q4k.tar.sha256 / cohort558_q16k.tar.sha256 = 整个tar的SHA-256；按名称顺序cat各分卷即可重建tar）；MANIFEST.tsv给出了每个组装的HPRC索引源URL和哈希、FASTA的XXH3以及两个归档文件的SHA-256；每个归档文件均可解码回其源FASTA（XXH3 == 源）。读取器与格式：panvram（FORMAT.md）。参考序列未包含在内（NCBI GCA_009914755.4，FASTA的md5见DATASET.md）。
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