Open-Neo HCC1395/HCC1395BL 公共全基因组测序测试数据

提供乳腺癌细胞系HCC1395和正常对照的配对全基因组测序数据,用于验证体细胞变异检测和新抗原识别流程。

open-neoopen-neo
HuggingFace
2026-09-07 更新
浏览 51
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Open-Neo HCC1395/HCC1395BL Public WGS Test Data

基本信息

模态
基因组
大小
216 GB
数据量
10
许可
other
创建/更新时间
2026-09-07

资源简介

Open-Neo HCC1395/HCC1395BL 公共全基因组测序测试数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《open-neo/open-neo-public-test-data》。源站首次发布:2026-08-26。

【数据内容】

源站原始描述:# Open-Neo HCC1395/HCC1395BL Public WGS Test Data This dataset provides a public paired whole-genome test case for validating the Open-Neo installation, input-QC, DNA evidence, purity/CNV, HLA, candidate generation, presentation, ranking, and reporting paths. ## Samples | Role | Sample | BioSample | Source material | |-|-|-|-| | Tumor | HCC1395 (`WGS_EA_T_1`) | SAMN10102573 | Breast carcinoma cell line, ATCC CRL-2324 | | Matched normal | HCC1395BL (`WGS_EA_N_1`) | SAMN10102574 | B-…

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 216.00 GB。

【主题与分类】

主题标签:task_categories:other、license:other、size_categories:n<1K、format:csv、modality:text、library:datasets、library:pandas、library:polars、library:mlcroissant、region:us。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/open-neo/open-neo-public-test-data

使用许可:other。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-09-07,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("open-neo/open-neo-public-test-data")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install &amp;&amp; git clone https://hf-mirror.com/datasets/open-neo/open-neo-public-test-data

完整数据卡:huggingface.co/datasets/open-neo/open-neo-public-test-data

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