GEO数据库中原发性硬化性胆管炎的数据挖掘
该数据集包含从GEO数据库下载的原发性硬化性胆管炎（PSC）基因表达数据（GSE119600），通过生物信息学方法分析差异表达基因、进行功能富集和蛋白质相互作用网络构建，并评估免疫细胞浸润水平，主要用于PSC的分子机制研究、潜在生物标志物发现及免疫相关病理探索。
创建时间2024-09-27
更新时间2024-11-04
原始链接
https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=OA_cf4e8f36f8c1408d939c3eb6245bb39f
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资源简介
该数据集基于基因表达综合数据库（GEO）中的GSE119600数据集，针对原发性硬化性胆管炎（PSC）进行基因表达分析。数据集通过R软件处理，识别差异表达基因（DEGs），并利用在线工具进行基因本体（GO）功能分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。此外，通过STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析以识别PSC关键基因，并采用ssGSEA方法分析免疫细胞浸润情况。该数据集主要用于PSC的分子机制研究、生物标志物发现及免疫微环境探索。
提供机构：Yuling.Liu; Hong.LI; Jiao.Mu
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