BIDMC 活检确诊 MASLD 成人代谢组学队列

来自澳大利亚成人队列的去标识化血清代谢组学数据,该队列包括经活检证实患有MASLD和未患有MASLD的成人。主题标签:血清代谢组、靶向代谢组学、质谱数据、生物标志物发现、MASLD肝病、肝活检、成人队列

physionet
浏览 23
其他分类血清代谢组靶向代谢组学质谱数据生物标志物发现MASLD肝病肝活检成人队列
BIDMC Metabolomic Cohort of Adults with Biopsy-Proven MASLD

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
许可
PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0
创建/更新时间
2026-10-01
版本
1.0.0

资源简介

BIDMC 活检确诊 MASLD 成人代谢组学队列

来自澳大利亚成人队列的去标识化血清代谢组学数据,该队列包括经活检证实患有MASLD和未患有MASLD的成人。主题标签:血清代谢组、靶向代谢组学、质谱数据、生物标志物发现、MASLD肝病、肝活检、成人队列

bidmc-metabolomic-masld

【数据集背景】

本数据集源站标题为《BIDMC Metabolomic Cohort of Adults with Biopsy-Proven MASLD》。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):来自澳大利亚成人队列的去标识化血清代谢组学数据,该队列包括经活检证实患有MASLD和未患有MASLD的成人。包含通过UPLC-MS/MS(Metabolon Inc.)定量的1,618个靶向代谢组学特征。

【主题与分类】

主题标签:血清代谢组、靶向代谢组学、质谱数据、生物标志物发现、MASLD肝病、肝活检、成人队列。本站分类:消化系统疾病/脂肪肝(MASLD)。

【获取与许可】

源站页面:https://physionet.org/content/bidmc-metabolomic-masld/

使用许可:PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

需登录

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

暂未开放

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(PhysioNet)

PhysioNet 数据需注册账号(机构邮箱)并签署数据使用协议后下载:

  1. 在 https://physionet.org/content/bidmc-metabolomic-masld/1.0.0 页面登录并接受许可条款;
  2. 命令行整目录下载:
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/bidmc-metabolomic-masld/1.0.0/
  1. 或用官方工具(推荐,支持断点续传与校验):
pip install physionet-download
physionet-download bidmc-metabolomic-masld

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD),包括其进展型代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH),是慢性肝病的主要原因。准确阐明驱动肝脂肪变性、炎症和纤维化的代谢物及信号通路,对于支持进一步开发有效的筛查和治疗策略仍然至关重要。

引用

学术使用请引用:{Gutierrez de Piñeres et al. (2026). BIDMC Metabolomic Cohort of Adults with Biopsy-Proven MASLD. PhysioNet. doi:10.13026/a91p-k288 DOI 10.13026/a91p-k288。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案