MTBLS15545：PGM3驱动的己糖胺生物合成通过YBX1 O-GlcNAc糖基化促进肝细胞癌进展（非靶向代谢组学）

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS15545

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

磷酸葡萄糖变位酶3（PGM3）是己糖胺生物合成途径（HBP）中的限速酶之一，也是HBP代谢通量的关键调控因子。尽管PGM3的功能作用已在多种肿瘤中得到验证，但其在肝细胞癌（HCC）中的功能和分子机制仍有待阐明。本研究发现，PGM3在HCC组织中表达上调，且PGM3高表达与HCC患者不良预后密切相关。体外和体内结果表明，PGM3增强UDP-GlcNAc合成和蛋白质O-GlcNAc糖基化，从而促进HCC增殖、迁移和侵袭。对HCC细胞进一步进行O-GlcNAc糖基化组测序，鉴定出Y-box结合蛋白1（YBX1）是PGM3介导的O-GlcNAc糖基化的关键底物。值得注意的是，YBX1在特定丝氨酸残基（Ser165）位点的O-GlcNAc糖基化可增强其核转位。此外，我们验证了FR054——一种新近报道的PGM3抑制剂——通过减少PGM3介导的O-GlcNAc糖基化来延缓HCC进展。这些干预措施有效抑制HCC恶性进展。总而言之，我们的研究结果揭示了靶向PGM3-HBP-YBX1信号轴在HCC治疗中的潜在治疗价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。