MTBLS15555:酿酒酵母衰老相关突变体及黑腹果蝇中酵母-宿主相互作用的综合非靶向代谢组学数据集
衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母 Saccharomyces cerevisiae 和果蝇 Drosophila melanogaster 提供了互补的模型系统,用于研究衰老和长寿相关的保守代谢过程

基本信息
资源简介
MTBLS15555:酿酒酵母衰老相关突变体及黑腹果蝇中酵母-宿主相互作用的综合非靶向代谢组学数据集
衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母 Saccharomyces cerevisiae 和果蝇 Drosophila melanogaster 提供了互补的模型系统,用于研究衰老和长寿相关的保守代谢过程
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母 Saccharomyces cerevisiae 和果蝇 Drosophila melanogaster 提供了互补的模型系统,用于研究衰老和长寿相关的保守代谢过程。然而,描述衰老相关微生物遗传改变如何影响宿主代谢状态的全面的代谢组学资源仍然有限。在本研究中,我们生成了一个全面的非靶向代谢组学数据集,以表征与衰老相关的 S. cerevisiae 缺失菌株及其与 D. melanogaster 宿主相互作用相关的代谢改变。该数据集包括来自15株酵母菌株的基于液相色谱-质谱联用(LC–MS)的代谢组学图谱,其中包括BY4743对照菌株和14株衰老相关缺失菌株,以及暴露于不同酵母干预的果蝇组织的宿主代谢组学图谱。宿主样本包括在不同生命阶段采集的肠道组织和非肠道组织,从而能够评估对酵母遗传扰动的组织特异性和年龄相关代谢反应。生成的数据集包含原始和处理后的代谢组学数据、代谢物注释信息,以及描述生物学条件、遗传背景、组织来源、干预组和实验参数的综合样本元数据。这些数据为研究酵母来源的代谢调控、微生物-宿主相互作用以及年龄相关代谢重塑提供了可重复使用的资源。该代谢组学资源有助于对微生物遗传变异、宿主代谢适应和保守的衰老相关通路进行整合分析,并支持未来对微生物因子与宿主生理之间分子联系的研究。
【主题与分类】
主题标签:非靶向代谢组、质谱数据、衰老代谢、代谢疾病、酵母模型、果蝇模型、代谢物鉴定、差异分析。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS15555
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS15555
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母 Saccharomyces cerevisiae 和果蝇 Drosophila melanogaster 提供了互补的模型系统,用于研究衰老和长寿相关的保守代谢过程。然而,描述衰老相关微生物遗传改变如何影响宿主代谢状态的全面的代谢组学资源仍然有限。在本研究中,我们生成了一个全面的非靶向代谢组学数据集,以表征与衰老相关的 S. cerevisiae 缺失菌株及其与 D. melanogaster 宿主相互作用相关的代谢改变。该数据集包括来自15株酵母菌株的基于液相色谱-质谱联用(LC–MS)的代谢组学图谱,其中包括BY4743对照菌株和14株衰老相关缺失菌株,以及暴露于不同酵母干预的果蝇组织的宿主代谢组学图谱。宿主样本包括在不同生命阶段采集的肠道组织和非肠道组织,从而能够评估对酵母遗传扰动的组织特异性和年龄相关代谢反应。生成的数据集包含原始和处理后的代谢组学数据、代谢物注释信息,以及描述生物学条件、遗传背景、组织来源、干预组和实验参数的综合样本元数据。这些数据为研究酵母来源的代谢调控、微生物-宿主相互作用以及年龄相关代谢重塑提供了可重复使用的资源。该代谢组学资源有助于对微生物遗传变异、宿主代谢适应和保守的衰老相关通路进行整合分析,并支持未来对微生物因子与宿主生理之间分子联系的研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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