伴或不伴糜烂性食管炎受试者的临床特征

主题标签:嗜酸性食管炎、糜烂性食管炎、IL-13、转录组、食管活检、消化系统疾病。本站分类:消化系统疾病/嗜酸性食管炎。本数据集为消化系统疾病领域公开数据集,主题涵盖嗜酸性食管炎。

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基因组分类嗜酸性食管炎糜烂性食管炎IL-13转录组食管活检消化系统疾病
Clinical characteristics of subjects with or without erosive esophagitis.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

伴或不伴糜烂性食管炎受试者的临床特征

该数据集英文名称为 Clinical characteristics of subjects with or without erosive esophagitis.,归属于消化系统疾病 / 嗜酸性食管炎分类,来源于 ebi.ac.uk。其源站描述指向 Marc Rothenberg(2008)发布的人嗜酸性食管炎活检转录组 profiling 数据集,实验涉及培养并经 IL-13 刺激的样本,数据集编号为 E-GEOD-8853。围绕嗜酸性食管炎、糜烂性食管炎、IL-13、转录组、食管活检与消化系统疾病等主题,该数据集为相关研究提供了公开可获取的资源入口,适合关注食管炎症性疾病的转录组研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集聚焦消化系统疾病中的嗜酸性食管炎,并同时涉及糜烂性食管炎相关受试者的临床特征主题。源站描述表明,其原始研究为 Marc Rothenberg 于 2008 年发布的人嗜酸性食管炎活检转录组 profiling 工作,实验材料为培养并经 IL-13 刺激的样本。数据集名称强调“有或无糜烂性食管炎受试者的临床特征”,与主题标签中的嗜酸性食管炎、糜烂性食管炎、IL-13、转录组、食管活检相互呼应,体现了食管炎症条件下转录组层面观察的研究取向。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集属于转录组 profiling 数据,研究对象为人嗜酸性食管炎活检样本,并包含培养及 IL-13 刺激的处理条件。数据集名称还表明其涉及有或无糜烂性食管炎的受试者临床特征。主题标签涵盖嗜酸性食管炎、糜烂性食管炎、IL-13、转录组、食管活检与消化系统疾病。除上述信息外,样本数量、具体检测平台、数据文件类型与规模等细节源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述给出的数据集页面为 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-8853,发布者为 Marc Rothenberg,发布年份为 2008 年。原始研究主题为嗜酸性食管炎活检的转录组 profiling,样本经过培养并接受 IL-13 刺激。关于样本采集地点、伦理审批信息、受试者招募方式及临床特征的具体采集流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于消化系统疾病特别是嗜酸性食管炎相关转录组研究的参考,适合关注食管活检样本在 IL-13 刺激条件下基因表达变化的研究者使用。其主题同时涉及糜烂性食管炎,可用于围绕食管炎症性疾病分类与临床特征关联的探索性分析。由于数据集为公开资源,也可作为方法学比较、转录组数据再分析或教学演示的候选数据。具体适用分析类型与统计设计需结合源站页面进一步确认,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 上给出的数据集页面访问,页面标识为 E-GEOD-8853。使用者应依据源站提供的下载与说明信息获取数据,并遵循源站的使用条款。关于数据下载格式、预处理步骤、标准化方法及分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 2008 年发布的公开转录组 profiling 数据,主题集中于嗜酸性食管炎活检及 IL-13 刺激条件。其名称涉及有或无糜烂性食管炎受试者的临床特征,但样本量、临床变量完整度、批次信息与质量控制指标等源站未提供。使用者在解释结果时需注意数据集主题范围与实验条件的限定,不宜外推至未涵盖的人群或疾病亚型。

【引用与许可】

引用该数据集时,应参考源站描述中的引用信息:Marc Rothenberg (2008). Transcription profiling of human eosinophilic esophagitis biopsies, cultured and stimulated with IL-13 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-8853。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-8853

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Marc Rothenberg (2008). Transcription profiling of human eosinophilic esophagitis biopsies, cultured and stimulated with IL-13 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-8853

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