兔肝脏衰老定量蛋白质组学研究
该数据集来自 omicsdi.org,围绕兔肝脏随年龄增长的定量蛋白质组变化展开。研究采用定量蛋白质组学工作流,比较年轻、中年和老年三个年龄组兔肝脏的代谢变化,并检测到与线粒体功能障碍以及蛋白质、碳水化合物和脂肪代谢相关的富集蛋白类别

基本信息
资源简介
兔肝脏衰老定量蛋白质组学研究
该数据集英文名为 Quantitative Proteomics to Study Aging in Rabbit Liver,来自 omicsdi.org,围绕兔肝脏随年龄增长所发生的定量蛋白质组变化展开。研究采用定量蛋白质组学工作流,对年轻、中年和老年三个年龄组的兔肝脏进行比较,以追踪老年过程中肝脏内发生的代谢变化,并检测到与线粒体功能障碍以及蛋白质、碳水化合物和脂肪代谢相关的富集蛋白类别。数据集主题涉及代谢、增强多重检测、肝脏、Cpilot、定量蛋白质组学、衰老与兔等方向,在分类上归入消化系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集为研究肝脏衰老过程中的蛋白质层面代谢改变提供了定量比较数据,适合关注衰老、肝脏代谢与线粒体功能的研究者参考使用。
【数据集背景】
衰老伴随肝脏代谢功能的改变,而蛋白质是代谢过程的重要执行者,因此在蛋白质组层面定量刻画肝脏随年龄的变化具有研究价值。该数据集正是针对这一背景设计,聚焦兔肝脏在年龄增长过程中的定量蛋白质组变化。研究通过比较不同年龄阶段兔肝脏的蛋白质组,追踪老年过程中出现的代谢改变,并关注线粒体功能障碍以及蛋白质、碳水化合物和脂肪代谢等过程。数据集所属分类为消化系统疾病 / 其他,主题标签涵盖代谢、肝脏、衰老、定量蛋白质组学、兔以及增强多重检测和 Cpilot 等方向,体现了其在肝脏衰老与代谢研究中的定位。
【数据内容】
数据集的核心内容是兔肝脏的定量蛋白质组比较结果。研究设置了年轻、中年和老年三个年龄组,对这三个年龄组的兔肝脏进行定量比较,以反映随年龄增长而发生的蛋白质与代谢变化。源站描述指出,研究检测到与线粒体功能障碍相关的富集蛋白类别,以及与蛋白质代谢、碳水化合物代谢和脂肪代谢相关的富集蛋白类别。数据集主题标签中包含“增强多重检测”和“Cpilot”,表明研究采用了相应的定量蛋白质组学技术路线;具体检测到的蛋白数量、富集分析统计值、差异倍数等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,项目采用定量蛋白质组学工作流开展研究,研究对象为兔肝脏,样本按年龄划分为年轻、中年和老年三个组别,并在组间进行定量比较。关于样本的具体数量、兔的品系、饲养条件、取样与处理流程、质谱平台型号、色谱条件以及数据处理软件版本等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肝脏衰老相关的研究场景,例如比较不同年龄阶段肝脏蛋白质组差异、探讨线粒体功能障碍在肝脏衰老中的作用、分析蛋白质代谢、碳水化合物代谢与脂肪代谢随年龄的变化趋势等。由于主题标签涉及代谢、肝脏、衰老、定量蛋白质组学与兔,也可作为定量蛋白质组学方法在衰老研究中的应用参考。数据集分类归入消化系统疾病 / 其他,因此对关注肝脏相关疾病与代谢异常的研究者亦具有参考意义。需要说明的是,该数据集基于兔模型,向其他物种外推时需谨慎,具体适用性应结合研究设计判断。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕年轻、中年和老年三个年龄组的定量比较结果,检索与线粒体功能障碍、蛋白质代谢、碳水化合物代谢和脂肪代谢相关的富集蛋白类别,并据此开展差异分析与功能解释。由于主题标签中包含增强多重检测与 Cpilot,使用者可结合相应的定量蛋白质组学流程理解数据的产生方式。关于数据文件的具体格式、字段定义、下载方式、分析脚本与复现步骤,源站未提供,使用前需另行确认。
【质量与限制】
该数据集基于定量蛋白质组学工作流,对三个年龄组兔肝脏进行比较,并报告了富集蛋白类别,具备明确的研究设计框架。但源站描述未提供样本量、定量精度、缺失值处理、重复实验设置、统计显著性阈值以及验证实验等信息,因此难以据此评估数据的完整性与可靠性。此外,研究仅涉及兔肝脏这一物种与组织,结论的外推范围有限。上述未覆盖的质量相关细节,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息、发表期刊以及许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再分发数据前,应前往 omicsdi.org 相应页面核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD013220
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目描述了兔肝脏随年龄增长的定量变化。采用定量蛋白质组学工作流程追踪老年兔肝脏中发生的代谢变化。对三个年龄组(年轻、中年和老年兔)进行了定量比较,并检测到涉及线粒体功能障碍、蛋白质、碳水化合物和脂肪代谢的富集蛋白类别。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




