链脲佐菌素诱导糖尿病小鼠胰腺的定量3D OPT与LSFM数据集:数据集1

该数据集来自链脲佐菌素(STZ)诱导糖尿病小鼠模型,包含全胰腺β细胞质量分布的离体断层光学图像数据,覆盖单次高剂量、多次低剂量STZ给药以及血糖恢复小鼠

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时间序列图像分割Light sheet fluorescence microscopy3D Imagingoptical projection tomography3D reconstructionDiabetes mellitusanimal modelFOS: Medical and health sciences
Quantitative 3D OPT and LSFM datasets of pancreata from mice with streptozotocin-induced diabetes: Dataset 1

基本信息

模态
时间序列
大小
257.738863943 GB
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-13
版本
11

资源简介

链脲佐菌素诱导糖尿病小鼠胰腺的定量3D OPT与LSFM数据集:数据集1

Quantitative 3D OPT and LSFM datasets of pancreata from mice with streptozotocin-induced diabetes: Dataset 1

该数据集来自链脲佐菌素(STZ)诱导糖尿病小鼠模型,包含全胰腺β细胞质量分布的离体断层光学图像数据,覆盖单次高剂量、多次低剂量STZ给药以及血糖恢复小鼠。数据还提供单个胰岛β细胞的体积、空间坐标、形状以及胰岛素和GLUT2信号强度等结构信息。可用于研究STZ对β细胞质量分布的影响,支持三维空间定量分析、胰岛形态比较以及糖尿病动物模型的影像学评估(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2022。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):链脲佐菌素(STZ)诱导糖尿病的小鼠模型可能是临床前糖尿病研究中最广泛使用的系统,因为该化合物对胰腺β细胞具有毒性作用。然而,对于STZ给药后胰腺β细胞质量分布的全面认识仍然缺乏。此前的评估主要依赖于立体学切片的推断,其提供的三维空间和定量信息有限。本数据描述符提供了多个离体断层光学图像数据集,涵盖接受单次高剂量和多次低剂量STZ给药的小鼠以及血糖恢复小鼠的全β细胞质量分布。数据还包括结构特征信息,如单个胰岛β细胞体积、空间坐标和形状,以及胰岛素和GLUT2的信号强度。它们共同

【主题与分类】

主题标签:Light sheet fluorescence microscopy、3D Imaging、optical projection tomography、3D reconstruction、Diabetes mellitus、animal model。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.51c59zw8g

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.51c59zw8g

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 257.74 GB。

数据说明

链脲佐菌素(STZ)诱导糖尿病的 mouse 模型可能代表了临床前糖尿病研究中最广泛使用的系统,这归因于该化合物对胰腺 β 细胞的毒性作用。然而,关于 STZ 给药后胰腺 β 细胞质量分布的全面视图尚缺乏。以往的评估主要依赖于立体学切片的推断,这提供的 3D 空间和定量信息有限。本数据描述提供了接受单次高剂量和多次低剂量 STZ 给药以及血糖恢复的 mouse 中完整 β 细胞质量分布的多个离体断层光学图像数据集。数据还包括结构特征信息,如单个胰岛 β 细胞体积、空间坐标、形状以及胰岛素和 GLUT2 的信号强度。总之,它们提供了 STZ 给药对 mouse 朗格汉斯胰岛影响的最全面解剖记录。因此,本数据描述可作为参考材料,以促进这一广泛使用的疾病模型的规划、使用和(重新)解释。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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