PRJNA1180100：WNT信号通路促进小鼠梗阻后肝外胆管增殖反应[24小时批量]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281589

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胆道梗阻和胆管细胞过度增殖是影响大胆管（肝外胆管，EHBD）的胆管病变的重要特征。梗阻诱导EHBD胆管细胞增殖的机制仍知之甚少。发育通路，如WNT信号，已被认为参与调控许多组织（包括肝脏和胆管）的损伤反应。为了研究WNT信号对EHBD胆管细胞在梗阻性损伤后增殖反应的贡献，我们采用药理学干预和计算方法，结合互补的体内和体外模型开展了全面研究。为模拟梗阻，我们使用了小鼠胆管结扎（BDL）模型。使用人和小鼠胆管类器官及小鼠胆管外植体研究体外WNT激活和抑制的效果。我们观察到梗阻后WNT配体表达迅速上调，并与胆道增殖增加相关。胆管细胞被鉴定为既表达WNT配体又对WNT有反应的细胞。

抑制WNT信号通路在体内和体外均减少了胆管细胞增殖，而激活则增加了增殖。WNT对胆管细胞的促增殖效应依赖于β-catenin。我们的研究表明，胆管细胞来源的WNT配体可激活经典WNT信号通路，从而在梗阻性损伤后诱导增殖。这些发现提示WNT通路参与了肝外胆管（EHBD）内损伤诱导的胆管细胞增殖。总体设计：对假手术组和胆管结扎术后24小时小鼠的整个肝外胆管进行批量RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。