HIV感染者脂肪性肝病表型与遗传数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22694775

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

HIV感染者中SLD与纤维化的遗传及代谢决定因素 项目概述 本代码库包含一项多中心横断面研究的数据集、分析脚本和文档，该研究评估HIV感染者（PWH）中脂肪性肝病（SLD）和临床显著肝纤维化（CSF）背后的遗传与代谢因素。 研究标题：HIV感染者中脂肪性肝病与临床显著纤维化的遗传及代谢决定因素 研究队列：来自两个NIH资助的美国队列的1,089名病毒学控制良好、接受稳定抗逆转录病毒治疗（ART）的HIV感染成人 主要结局：代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）、MetALD及临床显著肝纤维化（CSF） 许可：许可：受限/受控访问（需签署数据使用协议） 数据集与变量 关键表型定义 脂肪性肝病（SLD）：通过振动控制瞬时弹性成像（VCTE）上的受控衰减参数（CAP）定义脂肪变性（n = 526，48%）。 MASLD：SLD加上心血管代谢危险因素且无有害饮酒（n = 403，37%）。

MetALD：SLD 符合 MASLD 代谢标准且伴中等量饮酒（n = 123，11%）。临床显著纤维化（CSF）：通过 VCTE 测量肝脏硬度（LSM）。在 18%（74/403）的 MASLD 和 15%（19/123）的 MetALD 参与者中检出。目标基因位点 PNPLA3（rs738409）TM6SF2（rs58542926）GCKR（rs780094）MBOAT7-TMC4（rs641738）HSD17B13（rs72613567）研究结果摘要 结局 关键遗传决定因素（aOR）人口学与代谢危险因素 MASLD PNPLA3-G（1.39）、TM6SF2-T（1.63）、MBOAT7-TMC4-T（1.23）、GCKR-T（1.25）较高的 BMI、2 型糖尿病、男性 MetALD PNPLA3-G（1.69）、MBOAT7-TMC4-T（1.47）较高的 BMI、2 型糖尿病、男性 SLD 中的 CSF PNPLA3-G（2.03）非西班牙裔黑人种族与较低的比值比相关（aOR 0.37）MASLD 中的 CSF PNPLA3-G（1.73）加入 PNPLA3 基因型可改善模型拟合（p <0.01）注：PNPL

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。