细菌间AI-2通讯驱动阶段特异性遗传程序支持鼠肠道沙门氏菌定植

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305594

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数据说明

通过AI-2介导的合作性应答使沙门氏菌能够协调和调控对其生存和感染至关重要的群体行为。在本研究中，我们报道鼠伤寒沙门氏菌利用AI-2信号调节趋化性和运动相关基因的表达以及细菌细胞表面鞭毛的形成。AI-2作为趋化引诱剂发挥作用，该级联反应介导沙门氏菌的趋化应答。这些调控有助于沙门氏菌在体外和鼠模型中黏附并侵入肠上皮细胞。此外，我们确定HilD——已知通过诱导沙门氏菌中的趋化受体和SPI-1来调控运动性——连同关键SPI-1基因，在缺乏LuxS/AI-2信号时表达不足，这揭示了AI-2在沙门氏菌中复杂的调控网络。在初始阶段之后，该信号通过调控pmrD/AB系统促进在多粘菌素B存在下的存活，并支持在上皮细胞内的胞内存活和持续存在，从而逃避抗菌肽免疫应答。

此外，我们的研究结果表明，沙门氏菌在Caco-2上皮细胞内激活其LuxS/AI-2信号级联。通过转录组分析获得的补充观察显示，LuxS/AI-2信号调控着与沙门氏菌致病不同阶段相关基因的协调调节。最后，利用小鼠模型，我们表明抑制LuxS/AI-2信号联合抗生素可作为一种替代治疗途径。因此，我们的研究剖析了AI-2信号介导鼠伤寒沙门氏菌致病多个阶段关键过程的综合调控机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。