鼠伤寒沙门菌与pan甲硫氨酸亚砜还原酶基因缺失株比较RNA测序分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318288

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肠道沙门氏菌鼠伤寒血清型（S. Typhimurium）是一种主要的食源性病原体，它能够承受并存活于氧化应激之中。甲硫氨酸亚砜还原酶（Msrs）是重要的抗氧化酶，通过将氧化的甲硫氨酸残基（游离的或结合在蛋白质中的）还原回甲硫氨酸，保护细胞免受氧化损伤。为了探究删除所有五个已知msr基因后的全局转录后果，对S. Typhimurium及Δ5msr突变株进行了RNA测序。该数据集为研究msrs缺失对S. Typhimurium中氧化应激相关调控途径和细胞过程的影响提供了全面的转录组资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。