Med14磷酸化塑造GLP-1激动剂基因组响应[ATAC-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299281

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在进食条件下，循环葡萄糖浓度升高会触发肠道L细胞释放胰高血糖素样肽-1（GLP-1）。GLP-1部分通过激活β细胞GLP-1受体并随后诱导cAMP信号通路，导致蛋白激酶A（PKA）介导的CREB磷酸化及CREB靶基因的诱导，从而促进胰岛素分泌和胰腺β细胞存活。与该通路对即刻早期CREB靶基因的急性效应（可减弱cAMP-CREB反应）不同，β细胞持续暴露于GLP-1激动剂（艾塞那肽-4；Ex-4）或腺苷酸环化酶激活剂（佛司可林；FSK）会以延迟动力学刺激β细胞特异性CREB靶基因的表达。在对介导GLP-1长期效应的转录共调节因子进行的蛋白质组学筛选中，我们鉴定出Med14——Mediator复合体的骨架亚基。暴露于Ex-4或FSK均可刺激Med14在Ser983位点的磷酸化，该位点对应于一个保守的PKA识别序列（RRXS），位于Med14的内在无序区域内。

Med14的磷酸化对于维持驱动β细胞特异性和糖尿病相关基因诱导的增强子至关重要。将Med14第983位丝氨酸突变为丙氨酸会减少β细胞数量，并抑制原代小鼠胰岛中的生长因子信号传导。我们的工作揭示了通用转录因子响应GLP-1类似物的磷酸化如何触发广泛的基因组反应，从而对β细胞功能产生有益影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。