GSE136670:TBK1调控胰腺b细胞再生

该数据集来自NCBI GEO,标题为TBK1调控胰腺b细胞再生,包含1个文件GSE136670_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为大鼠(10116),平台为GPL18694

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GSE136670: TBK1 Regulates Regeneration of Pancreatic b-cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

GSE136670:TBK1调控胰腺b细胞再生

TBK1 Regulates Regeneration of Pancreatic b-cells

该数据集来自NCBI GEO,标题为TBK1调控胰腺b细胞再生,包含1个文件GSE136670_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为大鼠(10116),平台为GPL18694。研究聚焦TBK1在胰腺b细胞增殖与细胞周期进程中的作用,通过基因沉默和过表达实验结合蛋白质组与转录组分析,揭示TBK1缺失促进b细胞增殖并上调核糖体蛋白和细胞周期调控因子。数据可用于探索b细胞再生相关分子机制及潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 30 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):诱导b细胞增殖是恢复b细胞质量最切实可行的治疗策略之一。然而,由于成人人类b细胞对增殖具有显著的抵抗性,这一方法已被证明具有挑战性。在此,我们旨在揭示一种非经典IkB激酶TBK1(TANK结合激酶1)在调控细胞周期进程中的作用,该激酶在哺乳动物胰岛中主要表达于b细胞。在INS-1 832/13大鼠b细胞系中基因沉默TBK1促进了b细胞增殖。蛋白质组学和转录组分析进一步揭示了在TBK1缺失后对细胞生长和增殖至关重要的蛋白质和基因的变化,包括核糖体蛋白和细胞周期调控因子的上调。TBK1过表达降低了b细胞对cAMP水平升高的敏感性,并以依赖于p活性的方式减少b细胞增殖。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18694、10116。本站分类:消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE136670

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

B细胞增殖诱导是恢复B细胞量最切实可行的治疗策略之一。然而,由于成人人类B细胞对增殖具有显著的抵抗性,这一方法已被证明具有挑战性。在此,我们旨在揭示一种非经典IκB激酶TBK1(TANK结合激酶1)在调控细胞周期进程中的作用,该激酶在哺乳动物胰岛B细胞中主要表达。在INS-1 832/13大鼠B细胞系中基因沉默TBK1可促进B细胞增殖。蛋白质组学和转录组分析进一步揭示了TBK1缺失后对细胞生长和增殖至关重要的蛋白质和基因的变化,包括核糖体蛋白和细胞周期调控因子的上调。TBK1过表达降低了B细胞对cAMP水平升高的敏感性,并以依赖磷酸二酯酶3(PDE3)活性的方式减少B细胞增殖。重要的是,使用(E)3-(3-苯基苯并[c]异噁唑-5-基)丙烯酸(PIAA)对TBK1进行药理学抑制,在基础条件下增强了大鼠和人胚胎干细胞(hESC)来源的产胰岛素B细胞的增殖和功能。

致糖尿病性损伤进一步诱导TBK1表达,相应地,PIAA保护β细胞免受细胞因子和链脲佐菌素诱导的致糖尿病性挑战,并促进β细胞复制。此外,PIAA增加了正常和2型糖尿病人类胰岛中β细胞的增殖,并伴随胰岛素分泌的增加。总之,这些数据揭示了TBK1作为β细胞复制的关键细胞自主负调控因子的新颖且 essential 功能,并将PIAA呈现为增强β细胞增殖和功能的有效治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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