显微镜下结肠炎患者结肠活检与血清中抑制性和刺激性生物标志物水平改变数据集
该数据集来自 figshare，包含 1 个 ZIP 文件，对应一项关于显微镜下结肠炎（MC）的研究。研究使用 Luminex 检测活动期 MC 患者（n=35）与对照（n=23）血清中 23 种免疫调节分子，并比较 MC 与溃疡性结肠炎（UC）患者及对照的结肠活检组织
基本信息
资源简介
显微镜下结肠炎患者结肠活检与血清中抑制性和刺激性生物标志物水平改变数据集
Data_Sheet_3_Patients With Microscopic Colitis Have Altered Levels of Inhibitory and Stimulatory Biomarkers in Colon Biopsies and Sera Compared to Non-inflamed Controls.ZIP
该数据集来自 figshare，包含 1 个 ZIP 文件，对应一项关于显微镜下结肠炎（MC）的研究。研究使用 Luminex 检测活动期 MC 患者（n=35）与对照（n=23）血清中 23 种免疫调节分子，并比较 MC 与溃疡性结肠炎（UC）患者及对照的结肠活检组织。数据可用于探索 MC 的免疫监视机制、免疫检查点相关标志物差异，以及 MC 与 UC 和对照之间的免疫调节特征比较（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Decreased Colorectal Cancer and Adenoma Risk in Patients with Microscopic Colitis》发表于 Digestive Diseases and Sciences（2011），DOI：10.1007/s10620-011-1852-2。源站首次发布：2024-11-12。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：引言：显微镜下结肠炎（MC）是一种炎症性肠道疾病，有两种亚型：淋巴细胞性结肠炎（LC）和胶原性结肠炎（CC）。与溃疡性结肠炎（UC）患者和非炎症个体不同，MC 患者发生结直肠癌的风险降低，可能是由于 MC 患者免疫监视增强。目的：检查 MC 患者血清中以及 MC 和 UC 患者结肠活检组织中免疫调节分子（包括参与免疫检查点机制的分子）水平与对照的差异。方法：使用 Luminex 检测活动期 MC 患者（n = 35）和对照（n = 23）血清中以及患者结肠活检组织中的 23 种分析物（4-1BB、4-1BBL、APRIL、BAFF、BTLA、CD27、CD28、CD80、CTLA-4、E-cadherin、Galectin-3、GITR、HVEM、IDO、IL-2Rα、LAG-3、MICA、MICB、PD-1、PD-L1、PD-L2、sCD40L 和 TIM-3）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 3.43 KB。数据集 DOI：10.3389/fmed.2021.727412.s003。
【主题与分类】
源站学科分类：Radiology and Organ Imaging、Foetal Development and Medicine、Obstetrics and Gynaecology、Primary Health Care、Medical and Health Sciences not elsewhere classified、Dermatology。主题标签：microscopic colitis、colorectal cancer、immune surveillance、immune checkpoints、ulcerative colitis、serum、colonic biopsies。本站分类：消化系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Radiology and Organ Imaging、Foetal Development and Medicine、Obstetrics and Gynaecology、Primary Health Care、Medical and Health Sciences not elsewhere classified、Dermatology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_3_Patients_With_Microscopic_Colitis_Have_Altered_Levels_of_Inhibitory_and_Stimulatory_Biomarkers_in_Colon_Biopsies_and_Sera_Compared_to_Non-inflamed_Controls_ZIP/27678504
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Lushnikova, Alexandra; Bohr, Johan; Wickbom, Anna; Münch, Andreas; Sjöberg, Klas; Hultgren, Olof; et al. (2024). Data_Sheet_3_Patients With Microscopic Colitis Have Altered Levels of Inhibitory and Stimulatory Biomarkers in Colon Biopsies and Sera Compared to Non-inflamed Controls.ZIP. Frontiers. Da…
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Data_Sheet_3_Patients With Microscopic Colitis Have Altered Levels of Inhibitory and Stimulatory Biomarkers in Colon Biopsies and Sera Compared to Non-inflamed Controls.ZIP
- DOI：10.3389/fmed.2021.727412.s003
- 发布日期：2024-11-12
- 文件数：1 个
- 文件总体积：3.43 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_3_Patients_With_Microscopic_Colitis_Have_Altered_Levels_of_Inhibitory_and_Stimulatory_Biomarkers_in_Colon_Biopsies_and_Sera_Compared_to_Non-inflamed_Controls_ZIP/27678504
命令行下载
curl -L -o "Data_Sheet_3_Patients With Microscopic Colitis Have Altered Levels of Inhibitory and Stimulatory Biomarkers in Colon Biopsies and Sera Compared to Non.ZIP" "https://ndownloader.figshare.com/files/50386542"
文件清单
Data_Sheet_3_Patients With Microscopic Colitis Have Altered Levels of Inhibitory and Stimulatory Biomarkers in Colon Biopsies and Sera Compared to Non.ZIP（3.43 KB）
文件总体积 3.43 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
引言：显微镜下结肠炎（MC）是一种炎症性肠病，分为两个亚型：淋巴细胞性结肠炎（LC）和胶原性结肠炎（CC）。与溃疡性结肠炎（UC）患者和非炎症个体不同，MC患者发生结直肠癌的风险降低，这可能归因于MC患者免疫监视增强。目的：研究与对照相比，MC患者血清中以及MC和UC患者结肠活检组织中免疫调节分子（包括参与免疫检查点机制的分子）水平的差异。方法：采用Luminex技术，对活动期MC患者（n=35）和对照（n=23）的血清，以及活动期LC患者（n=9）、活动期CC患者（n=16）、组织学缓解期MC患者（LC n=6，CC n=6）、活动期UC患者（n=15）、缓解期UC患者（n=12）和对照（n=58）的结肠活检组织中的23种分析物（4-1BB、4-1BBL、APRIL、BAFF、BTLA、CD27、CD28、CD80、CTLA-4、E-cadherin、Galectin-3、GITR、HVEM、IDO、IL-2Rα、LAG-3、MICA、MICB、PD-1、PD-L1、PD-L2、sCD40L和TIM-3）进行了研究。
结果：在血清中，与对照组相比，MC患者的IDO、PD-1、TIM-3、4-1BB、CD27和CD80降低，而4-1BBL和IL-2Rα升高。相反，在活检组织中，活动性疾病MC和UC患者的PD-L2和4-1BB水平升高。此外，在活动性疾病CC和UC患者（但非LC患者）的活检组织中，与对照组相比，CTLA-4、PD-1、APRIL、BAFF和IL-2Rα升高。PD-L1在CC患者中升高，但在UC或LC患者中未升高。与对照组相比，MC患者活检组织中CD27和TIM-3降低，而活动性UC患者中MICB水平较对照组降低。结论：与非炎症对照组相比，MC和UC患者的可溶性和膜结合免疫调节分子水平在全身和局部均发生改变，大多数分析物在血清中降低，但在结肠活检组织中升高。这些发现有助于了解检查点分子及其作为MC生物标志物的作用，也可能有助于了解MC对结肠癌看似保护作用背后的可能机制。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fmed.2021.727412.s003（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_3_Patients_With_Microscopic_Colitis_Have_Altered_Levels_of_Inhibitory_and_Stimulatory_Biomarkers_in_Colon_Biopsies_and_Sera_Compared_to_Non-inflamed_Controls_ZIP/27678504）。
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