TAF4 指导出生后肝细胞分化中核受体 HNF4A 启动子占据的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.62gj0

标准获取流程：

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数据集大小约 546.7 KB。

数据说明

哺乳动物TFIID中TAF亚基在生理过程中的功能仍鲜有表征。本文描述了TAFs在引导转录激活因子占据基因组方面的一种新功能。通过在小鼠中进行肝脏特异性失活，我们发现TFIID的TAF4亚基是出生后肝细胞成熟所必需的。TAF4促进出生后表达的肝功能基因处预起始复合物（PIC）的形成，并通过增加RNA聚合酶II暂停来下调一部分胚胎期表达基因。TAF4-TAF12异二聚体直接与HNF4A相互作用，并且在体内，TAF4对于维持出生后阶段HNF4A引导的胚胎基因表达是必需的，并促进HNF4A占据邻近出生后表达基因转录起始位点的功能性顺式调控元件。HNF4A对这些调控元件的稳定占据需要TAF4依赖性的PIC形成，这突出表明这些是相互依赖的事件。因此，局部启动子近端的HNF4A-TFIID相互作用充当出生后肝细胞分化的指导性信号。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。