小鼠Paneth细胞功能缺失改变未成熟肠道微生物组并模拟新生儿坏死性小肠结肠炎变化的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.1h5183k

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 2.57 GB。

数据说明

坏死性小肠结肠炎（NEC）仍是早产儿胃肠道疾病发病和死亡的主要原因。人类和动物研究表明，潘氏细胞在NEC发病机制中发挥作用。潘氏细胞在宿主-微生物相互作用和上皮稳态中起关键作用。消除潘氏细胞功能对未成熟宿主-微生物轴的影响尚不完全清楚。我们使用化学和遗传模型耗竭未成熟小鼠肠道中的潘氏细胞功能，导致与NEC一致的肠道损伤。通过组织学、电子显微镜、流式细胞术和实时RT-PCR证实了潘氏细胞耗竭。在不同时间点分析盲肠样本，以确定潘氏细胞耗竭伴或不伴克雷伯菌灌胃对微生物组的影响。潘氏细胞功能缺陷引起盲肠微生物组组成的显著变化，肠杆菌科物种显著增加。此外，发生的肠杆菌科物种暴发在表型上与人NEC中所见相似。

这进一步加深了我们对潘氏细胞在未成熟肠道中对肠道稳态重要性的理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。