NICU早产儿胃部细菌定植趋势与决定因素

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae8bf8a7dde03d55a50c364c4002490f0ba68e48a71815702811117ead1fcbdcd

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：新生儿胃肠道（GI）道被认为是无菌的，但会迅速从其密切接触的环境中获取多样化的微生物群。上消化道中细菌种类的早期获取可能对结肠微生物群的形成发挥作用。关于早产儿上消化道微生物群的分子数据较为缺乏。方法：前瞻性收集了22名入住新生儿重症监护病房的新生儿出生后第1-4周的胃吸出物，其平均胎龄为27.7周（±2.8），体重为973.2克（±297.9）。所有样本均采用基于16S rRNA的变性梯度凝胶电泳评估微生物群。分析了细菌种类的定植及其与母亲和新生儿人口学特征以及新生儿临床特征之间的关联。结果：拟杆菌属（Bacteroides spp.）是所有四周中的优势菌种。与部分……相比，纯母乳喂养者的双歧杆菌属（Bifidobacterium spp.）定植显著更高。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。