反刍动物胃肠道从出生到成年的综合转录谱
该数据集来自 sheep（Ovis aries）高分辨率基因表达图谱的 RNA-Seq 子集，覆盖从 pre-ruminant 到 ruminant 转变过程中整个胃肠道（GI tract）的转录特征
基本信息
资源简介
反刍动物胃肠道从出生到成年的综合转录谱
该数据集来自 sheep（Ovis aries）高分辨率基因表达图谱的 RNA-Seq 子集，覆盖从 pre-ruminant 到 ruminant 转变过程中整个胃肠道（GI tract）的转录特征。数据包含四个时间点（出生、一周、8 周和成年）的 168 个 sheep 组织样本，提供个体 sheep 的 TPM 基因表达估计值（Table S4）以及个体间平均值（Table S1）。可用于研究反刍动物胃肠道发育、rumen 建立及相关基因表达变化（来源 datashare.ed.ac.uk）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：新生和幼年反刍动物面临的最重要生理挑战之一是瘤胃的发育和建立。利用我们 sheep（Ovis aries）高分辨率基因表达图谱中的一部分 RNA-Seq 数据，我们首次全面表征了从 pre-ruminant 向 ruminant 转变过程中整个胃肠道（GI）的转录情况。该数据集包含来自 sheep 四个不同时间点（出生、一周、8 周和成年）的 168 个组织样本。此处包含个体 sheep 的基因表达估计值，以 transcripts per million（TPM）表示（Table S4），以及个体间平均值（Table S1）。
【主题与分类】
主题标签：transcription、sheep、goat、ruminant、gastrointestinal tract、development、macrophage、immunity、RNA-Seq、FAANG。本站分类：消化系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3113
下载信息
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
新生和幼龄反刍动物面临的最重要生理挑战之一是瘤胃的发育和建立。利用我们绵羊（Ovis aries）高分辨率基因表达图谱中的一部分RNA-Seq数据，我们首次全面描述了从反刍前到反刍转变过程中整个胃肠道（GI）的转录情况。该数据集包含来自四个不同时间点（出生、一周、8周和成年）绵羊的168个组织样本。此处包括单个绵羊的基因表达估计值，以每百万转录本（TPM）表示（表S4），以及个体间的平均值（表S1）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
