健康孕妇与肝内胆汁淤积症患者的胆汁酸谱

数据围绕健康孕妇与肝内胆汁淤积症(ICP)患者的胆汁酸谱,涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学研究,比较 ICP 患者、ICP 亚型、ICP 胎儿、ICP 模型等不同实验组,可用于识别 ICP 关键分子及功能通路,辅助理解病理机制并探索精准临床生物标志物

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2024-01-08 更新
浏览 8
基因组分类genomicsintrahepatic cholestasis of pregnancymetabolomicstranscriptomicsperinatal complicationprecise diagnosisproteomics
Bile acid profile in healthy pregnant women and patients with intrahepatic cholestasis of pregnancy (ICP).

基本信息

模态
基因组
大小
0.000018363 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-01-08
版本
v1

资源简介

健康孕妇与肝内胆汁淤积症患者的胆汁酸谱

Table_1_An omics review and perspective of researches on intrahepatic cholestasis of pregnancy.xlsx

该数据集来自 figshare,包含 1 个 Excel 文件,标题为 Table_1_An omics review and perspective of researches on intrahepatic cholestasis of pregnancy.xlsx,配套论文为 2020 年发表于 Journal of Clinical Medicine 的综述。数据围绕健康孕妇与肝内胆汁淤积症(ICP)患者的胆汁酸谱,涉及基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学研究,比较 ICP 患者、ICP 亚型、ICP 胎儿、ICP 模型等不同实验组,可用于识别 ICP 关键分子及功能通路,辅助理解病理机制并探索精准临床生物标志物。

【数据集背景】

配套论文《Intrahepatic Cholestasis in Pregnancy: Review of the Literature》发表于 Journal of Clinical Medicine(2020),DOI:10.3390/jcm9051361。源站首次发布:2024-01-08。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肝内胆汁淤积症(ICP)是常见的妊娠并发症之一,可能威胁孕妇及其胎儿的健康。因此,识别 ICP 的关键分子及相关功能通路至关重要,这将有助于更好地理解其病理机制并开发精准的临床生物标志物。多种组学方法的出现和发展使得对临床样本的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组进行综合研究成为可能。本综述收集并总结了基于组学的 ICP 研究,旨在概述当前进展、局限性和未来方向。简而言之,这些研究通过比较不同实验组(包括 ICP 患者、ICP 亚型、ICP 胎儿、ICP 模型及其他)涵盖了广泛的研究内容。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 18.36 KB。数据集 DOI:10.3389/fendo.2023.1267195.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。主题标签:genomics、intrahepatic cholestasis of pregnancy、metabolomics、transcriptomics、perinatal complication、precise diagnosis、proteomics。本站分类:消化系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_An_omics_review_and_perspective_of_researches_on_intrahepatic_cholestasis_of_pregnancy_xlsx/24957933

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, Min; Chen, Lingyan; Li, Jingyang; You, Yilan; Qian, Zhiwen; Liu, Jiayu; et al. (2024). Table_1_An omics review and perspective of researches on intrahepatic cholestasis of pregnancy.xlsx. Frontiers. Dataset

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_1_An omics review and perspective of researches on intrahepatic cholestasis of pregnancy.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/43950480"

文件清单

  • Table_1_An omics review and perspective of researches on intrahepatic cholestasis of pregnancy.xlsx(18.36 KB)

文件总体积 18.36 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)是常见的妊娠并发症之一,可能威胁孕妇及胎儿的健康。因此,识别ICP的关键分子及其相关功能通路至关重要,这将有助于我们更好地理解其病理机制并开发精准的临床生物标志物。多种组学方法的涌现和发展使得对临床样本的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组进行综合研究成为可能。本综述收集并总结了基于组学的ICP研究,旨在概述当前进展、局限性及未来方向。简而言之,这些研究通过比较不同实验组涵盖了广泛的研究内容,包括ICP患者、ICP亚型、ICP胎儿、ICP模型及其他并发症。相应地,所研究的样本包含多种类型的临床样本、体外培养组织、细胞系以及动物模型样本。

根据主要研究目标,我们进一步将这些研究分为两组:发病机制分析和诊断分析。发病机制研究确定了数十条功能通路,这些通路可能是ICP发生、进展、治疗及胎儿影响的关键调控事件。另一方面,诊断研究测试了40多种潜在模型,用于ICP的早期预测、诊断、分级、预后或鉴别诊断。除这些成果外,我们还评估了当前研究的局限性,并强调临床特征、样本处理和分析方法等多个方面均可极大影响组学结果的可靠性和可重复性。最后,我们还指出了未来基于组学分析ICP及其他围产期相关疾病的几个新方向。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fendo.2023.1267195.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_An_omics_review_and_perspective_of_researches_on_intrahepatic_cholestasis_of_pregnancy_xlsx/24957933)。

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