激光治疗与创伤人体皮肤晚期修复中光老化相关基因表达模块持续存在的可重复性数据与代码
该数据集为一项跨研究配对转录组再分析提供完整可重复性材料,整合GEO公共人体皮肤数据(GSE125429、GSE38308、GSE168760、GSE131789、GSE39170、GSE206495、GSE152781、GSE241124、GSE241132),将预先固定的两个基因集(232基因慢

基本信息
资源简介
激光治疗与创伤人体皮肤晚期修复中光老化相关基因表达模块持续存在的可重复性数据与代码
Reproducibility data and code for: A photoaging-associated gene expression module persists during late repair of laser-treated and wounded human skin
该数据集为一项跨研究配对转录组再分析提供完整可重复性材料,整合GEO公共人体皮肤数据(GSE125429、GSE38308、GSE168760、GSE131789、GSE39170、GSE206495、GSE152781、GSE241124、GSE241132),将预先固定的两个基因集(232基因慢性UVA集及其13基因皮肤支持子集)迁移至14供者点阵激光时间进程和独立12供者安慰剂侧打孔创伤RNA测序队列,并含探索性单细胞与空间背景。数据可用于皮肤光老化、激光与创伤修复的转录组可重复性验证及基因表达模块分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含一项跨研究配对转录组再分析的完整可重复性材料,分析对象为公共人体皮肤数据(GEO登录号GSE125429、GSE38308、GSE168760、GSE131789、GSE39170、GSE206495、GSE152781、GSE241124和GSE241132)。相关研究将预先固定的两个基因集(一个在人体真皮成纤维细胞中定义的232基因慢性紫外线A集,及其在配对日晒/防护皮肤中定义的13基因皮肤支持子集)迁移至一个14供者点阵激光时间进程和一个独立的12供者安慰剂侧打孔创伤RNA测序队列,并包含探索性单细胞与空间背景。该存档由两个压缩包组成。Reproducibility_data_and_code.zip包含公共数据输入、冻结的基因集定义、供者配对与跨登录号重叠审计、处理后表达矩阵、数值结果、分析与重算
【主题与分类】
主题标签:Dermatology、Clinical medicine、photoaging、ultraviolet A、fractional laser、wound healing、skin rejuvenation、transcriptomics、gene expression、reproducibility。本站分类:损伤、中毒及外因。
【获取与许可】
源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=84d1bbc0112741c5878a02e5c05915ae
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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数据集获取
源站:https://doi.org/10.57760/sciencedb.015cg
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含对公开人类皮肤数据进行跨研究配对转录组重分析的完整可重复性材料(GEO登录号GSE125429、GSE38308、GSE168760、GSE131789、GSE39170、GSE206495、GSE152781、GSE241124和GSE241132)。相关研究将两个预先固定的基因集(一个是在人类真皮成纤维细胞中定义的232基因慢性紫外线A基因集,及其在配对日光暴露/防护皮肤中定义的13基因皮肤支持子集)迁移至一个14名供者的点阵激光时间进程队列和一个独立的12名供者安慰剂侧打孔伤RNA测序队列,并辅以探索性单细胞和空间背景分析。该数据存放包含两个压缩包。Reproducibility_data_and_code.zip包含公共数据输入、冻结的基因集定义、供者配对和跨登录号重叠审计、处理后的表达矩阵、数值结果、分析与重计算脚本以及验证输出。
Reproducibility_extension_20260914.zip 包含分析计划及带时间戳的修订记录、单细胞伪批量计数与合格性记录、空间区域计数及图像/坐标来源信息、所有基因水平和供体水平结果、条件参考基因集、脚本、环境要求以及独立数值验证。分析可使用所包含的预处理矩阵离线重新运行;验证脚本可复现所报告的批量(386 项检查)和空间(56 项检查)数值输出。未涉及新的人类参与者、组织样本或实验;所有源数据均为公开且已去标识化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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