克罗恩病患者来源培养大肠杆菌分离株的蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD010920

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在CD患者中经常观察到的一种菌群失调是大肠杆菌丰度增加（与健康个体相比增加10-100倍）[Gevers等，2014]。从CD患者和健康患者中分离出的大肠杆菌在好氧条件下于LB培养基中培养至对数生长中期，并通过HPLC-MS/MS鸟枪蛋白质组学分析其总蛋白质组。参考文献：Gevers D, Kugathasan S, Denson LA, Vazquez-Baeza Y, Van Treuren W, Ren B, 等。新发克罗恩病的未治疗微生物组。2014. Cell Host Microbe 15: 382–92。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。