PRJNA1446891:肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞图谱

该数据集为 NCBI BioProject 编号 PRJNA1446891 的项目,主题为肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞图谱分析,属于消化系统疾病/克罗恩病方向

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1446891: Single-cell profiling of a mouse model for perianal fistulizing Crohn's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1446891:肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞图谱

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1446891,英文名称为“Single-cell profiling of a mouse model for perianal fistulizing Crohn's disease”,中文可理解为肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞图谱分析项目。从分类上看,它归属于消化系统疾病中的克罗恩病方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签为“Raw sequence reads”。整体而言,这是一个围绕特定小鼠疾病模型开展单细胞层面研究的生物项目记录,用户可通过该记录获取与项目相关的数据链接与入口信息。以下将依据已知信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

克罗恩病是一种消化系统疾病,而肛周瘘管型克罗恩病是其复杂表现形式之一。该数据集所对应的项目聚焦于这一疾病方向的小鼠模型,并采用单细胞图谱分析作为研究手段。BioProject 作为生物数据集合的记录形式,通常来源于单一机构或联盟,旨在围绕某一研究计划汇集多种类型的数据。该记录为用户提供了一个统一的位置,以便查找由该项目产生的不同类型数据。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其涉及原始序列读长这类数据。整体来看,该数据集属于消化系统疾病/克罗恩病方向,并围绕肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞分析展开。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其数据内容涉及原始序列读长。项目名称为“Single-cell profiling of a mouse model for perianal fistulizing Crohn's disease”,即针对肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型的单细胞图谱分析。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、细胞类型、分析流程、数据文件格式与规模等细节,源站未提供。因此,无法进一步描述其数据组成的具体构成。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标题为“ID 1446891 - BioProject - NCBI”。其 BioProject 编号为 PRJNA1446891。根据源站描述,BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合,记录为用户提供查找该项目所产生多种数据类型链接的统一入口。关于样本采集地点、时间、伦理审批、实验条件等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与消化系统疾病、克罗恩病,特别是肛周瘘管型克罗恩病小鼠模型相关的单细胞研究场景。由于主题标签为“Raw sequence reads”,它可能用于需要原始序列读长的分析工作。此外,该记录也可作为查找该项目所产生多种数据类型链接的入口。关于更具体的适用场景,如特定分析任务或应用方向,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录编号 PRJNA1446891 访问该项目的记录页面,并利用该记录查找与项目相关的不同类型数据的链接。关于数据下载方式、分析工具、处理步骤等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录,其主题标签为“Raw sequence reads”。关于数据质量指标、覆盖度、批次效应、技术偏差、样本量限制等具体质量与限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录标题为“ID 1446891 - BioProject - NCBI”,BioProject 编号为 PRJNA1446891。关于引用方式、许可条款、使用限制等具体信息,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1446891

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在明确肛周瘘管型克罗恩病(pfCD)愈合受损的细胞和分子机制。利用一种能够再现人类pfCD关键特征的新型小鼠模型,我们进行了单细胞RNA测序,以绘制瘘管微环境的动态图谱。一个核心目标是通过比较野生型小鼠与Padi4基因敲除小鼠(后者在遗传上缺乏NET形成能力)来探究中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)的致病作用。该数据集为了解NETs如何驱动慢性炎症、破坏组织修复程序并导致瘘管持续存在提供了基础性资源。

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