E-GEOD-102133:克罗恩病患者回肠黏膜基因表达谱

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,聚焦克罗恩病患者回肠黏膜的基因表达谱分析

expression_atlas
浏览 2
基因组分类Differential
E-GEOD-102133: Mucosal gene expression profiling in ileum of patients with Crohn's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

E-GEOD-102133:克罗恩病患者回肠黏膜基因表达谱

E-GEOD-102133 是一项聚焦克罗恩病(Crohn's disease)回肠黏膜基因表达谱的研究数据集,英文全称为 Mucosal gene expression profiling in ileum of patients with Crohn's disease。该数据集收录于 EBI Expression Atlas,属于差异表达(Differential)实验类型,物种为人类(Homo sapiens)。数据集围绕克罗恩病患者回肠部位黏膜组织的基因表达特征展开,可用于观察疾病状态下回肠黏膜转录层面的变化。在分类上,该数据集归入消化系统疾病下的克罗恩病方向,主题标签为 Differential,体现了其以组间差异比较为核心的分析定位。整体而言,该数据集为研究克罗恩病累及回肠时的黏膜分子特征提供了表达谱层面的实验资源。

【数据集背景】

克罗恩病是一种累及消化道的炎症性疾病,回肠是其常见受累部位之一。黏膜组织中的基因表达改变往往反映局部炎症与组织损伤的分子状态,因此对回肠黏膜进行表达谱分析是理解该疾病机制的重要途径。E-GEOD-102133 正是围绕这一方向组织的差异表达实验,其英文标题明确指向克罗恩病患者回肠黏膜的基因表达谱分析。该数据集由 EBI Expression Atlas 收录,属于该平台中的 Differential 类实验,说明其设计目的并非单纯展示表达量,而是支持组间差异表达的比较与解读。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Differential,表明其内容组织围绕差异表达结果展开。物种信息为 Homo sapiens,即数据来自人类样本。研究材料为回肠黏膜,关注的是克罗恩病患者该部位黏膜的基因表达谱。源站描述中给出的信息集中于实验主题与物种,未进一步说明样本数量、分组方式、检测平台、基因数量或具体差异表达基因列表等细节,这些内容源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即由 EBI Expression Atlas 平台收录与发布。源站将其描述为一项 Expression Atlas experiment(Differential),物种为 Homo sapiens,研究主题为克罗恩病患者回肠黏膜的基因表达谱分析。除上述来源与实验类型信息外,关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、测序或芯片平台等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其差异表达实验的定位,该数据集适用于考察克罗恩病回肠黏膜在转录层面的组间差异,可用于探索疾病相关表达变化、筛选候选差异基因,以及作为消化系统疾病尤其是克罗恩病方向表达谱研究的参考资源。由于主题标签为 Differential,其典型用途包括差异表达结果的查阅与比较分析。需要说明的是,具体可支持的深入分析类型取决于源站所提供的数据内容,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

该数据集通过 EBI Expression Atlas 平台发布,用户可按照该平台的实验页面组织方式访问其差异表达实验信息。关于具体的下载格式、分析工具接口、数据文件组织与使用步骤,源站未提供详细说明,使用时应以平台页面实际提供的内容为准。

【质量与限制】

该数据集为 EBI Expression Atlas 收录的差异表达实验,物种与组织信息明确为 Homo sapiens 与回肠黏膜。但关于样本量、批次效应、统计方法、阈值设定、验证实验等质量相关信息,源站未提供。因此在使用时应注意其结论的适用范围,相关质量控制细节需参考源站页面或原始研究,当前信息不足以对其质量作出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 EBI Expression Atlas 平台。关于具体的引用文献、作者信息、许可条款与使用限制,源站未提供,使用或再分发前应查阅平台页面中的相应说明。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-102133

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Mucosal gene expression profiling in ileum of patients with Crohn’s disease

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案