无柄锯齿状腺瘤/息肉的原始CpG岛甲基化表型
该数据集包含17例无柄锯齿状腺瘤/息肉和15例传统腺瘤的组织样本及其正常黏膜对照的DNA甲基化与RNA测序数据，通过亚硫酸氢盐下一代测序技术检测了约270万个CpG位点的甲基化水平，并分析了样本的转录组信息，主要用于研究结肠癌前病变的表观遗传特征、鉴别不同息肉类型的甲基化模式差异，以及开发基于甲基化标志物的早期诊断与预警工具。
基本信息
资源简介
该数据集聚焦于无柄锯齿状腺瘤/息肉（SSA/Ps）的表观遗传特征研究。SSA/Ps被认为是约20%具有CpG岛甲基化表型（CIMP）结肠癌的前体病变。数据集包含17例SSA/Ps和15例传统腺瘤（cADNs）的新鲜组织样本，每例均配有正常黏膜对照样本。通过亚硫酸氢盐下一代测序技术，检测了约270万个CpG位点的甲基化水平，这些位点主要位于基因调控区域，覆盖80.5Mb基因组区域；同时进行了RNA测序以分析样本的转录组。研究发现SSA/Ps表现出独特的甲基化模式（称为原始CIMP），其特征是CpG岛及岸区的广泛高甲基化，且与基因表达上调相关，而cADNs则以低甲基化区域为主。该数据集为理解结肠癌前病变的表观遗传机制提供了重要资源，可用于开发基于DNA甲基化的生物标志物，辅助SSA/Ps和cADNs的鉴别诊断与早期预警。
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数据说明
该数据集聚焦于无柄锯齿状腺瘤/息肉（SSA/Ps）的表观遗传特征研究。SSA/Ps被认为是约20%具有CpG岛甲基化表型（CIMP）结肠癌的前体病变。数据集包含17例SSA/Ps和15例传统腺瘤（cADNs）的新鲜组织样本，每例均配有正常黏膜对照样本。通过亚硫酸氢盐下一代测序技术，检测了约270万个CpG位点的甲基化水平，这些位点主要位于基因调控区域，覆盖80.5Mb基因组区域；同时进行了RNA测序以分析样本的转录组。研究发现SSA/Ps表现出独特的甲基化模式（称为原始CIMP），其特征是CpG岛及岸区的广泛高甲基化，且与基因表达上调相关，而cADNs则以低甲基化区域为主。该数据集为理解结肠癌前病变的表观遗传机制提供了重要资源，可用于开发基于DNA甲基化的生物标志物，辅助SSA/Ps和cADNs的鉴别诊断与早期预警。
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