“研究类固醇调节胆道闭锁中免疫介导炎症的类器官系统”支持数据集

该数据集包含用于研究类固醇在胆道闭锁术前治疗中作用的实验数据,主要数据模态包括通过类器官技术获得的体外细胞实验数据(如基因表达和炎症指标)以及动物模型产生的体内表型数据(如组织病理学切片),旨在探究类固醇抗炎机制对改善胆道闭锁手术预后的潜在价值,服务于肝胆疾病机制研究与新辅助治疗策略开发。

HKU Data RepositoryHKU Data Repository
datahub.hku.hk
2024-08-31 更新
浏览 25
organoidanimal modelBA childrensteroid
Supporting data for "Organoid systems to study the effect of steroids in modulating immune-mediated inflammation in biliary atresia"

基本信息

许可
CC BY-NC 4.0
创建/更新时间
2024-08-31
版本
v1

资源简介

“研究类固醇调节胆道闭锁中免疫介导炎症的类器官系统”支持数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Supporting data for "Organoid systems to study the effect of steroids in modulating immune-mediated inflammation in billary atresia"》。源站首次发布:2022-08-15。

【数据内容】

源站原始描述:Biliary atresia (BA) is devastating congenital anomaly characterized by inflammatory fibrosclerosing changes of the extra- and intra-hepatic biliary systems. It is the most frequent cause of persistent neonatal cholestasis globally, with a higher incidence observed in the Asia-Pacific regions including Hong Kong. It is widely believed that most BA start with a series of abnormal immune interactions that trigger biliary inflammation as the common pathway. The critical role of inflammation in the…

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 12.06 MB。dataset2.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,18.50 KB。Readme file.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,14.06 KB。数据集 DOI:10.25442/hku.20380662.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Paediatrics not elsewhere classified、Infant and child health。主题标签:organoid、animal model、BA children、steroid。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Paediatrics not elsewhere classified、Infant and child health。

【获取与许可】

源站页面:https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_Organoid_systems_to_study_the_effect_of_steroids_in_modulating_immune-mediated_inflammation_in_billary_atresia_/20380662

使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。

规范引用:Liu, Fangran (2022). Supporting data for "Organoid systems to study the effect of steroids in modulating immune-mediated inflammation in billary atresia". HKU DataHub. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-08-31,引用时请注意版本时效。

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源站:https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_Organoid_systems_to_study_the_effect_of_steroids_in_modulating_immune-mediated_inflammation_in_billary_atresia_/20380662/1

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个医学研究数据集,旨在支持一项关于类固醇在胆道闭锁(Biliary atresia, BA)术前治疗中作用的研究。数据集内容聚焦于通过类器官技术和动物模型,探究类固醇(如地塞米松)在调节胆道闭锁相关免疫介导炎症过程中的效果。数据可能包括体外类器官培养的实验数据(如基因表达、细胞活性、炎症因子水平)以及体内动物模型的表型观察数据(如肝脏组织病理学、胆道炎症与纤维化程度)。该研究的目标是为胆道闭锁的术前新辅助治疗提供科学依据,探索通过抗炎治疗改善手术(葛西手术)预后的可能性。数据来源于香港大学相关研究项目,主要应用于肝胆疾病、儿科肝病、免疫炎症机制及药物开发等研究方向。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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