肥厚型心肌病综合血浆蛋白质组学分析
主题标签：肥厚型心肌病、血浆蛋白质组学、心血管系统疾病、蛋白质组、血浆。本站分类：心血管系统疾病/肥厚型心肌病。本数据集为心血管系统疾病领域公开数据集，主题涵盖肥厚型心肌病。
基本信息
资源简介
肥厚型心肌病综合血浆蛋白质组学分析
Comprehensive Plasma Proteomics Profiling of Hypertrophic Cardiomyopathy 是一个面向心血管系统疾病研究的公开蛋白质组学数据集，聚焦于肥厚型心肌病（Hypertrophic Cardiomyopathy）这一具体病种，以血浆为分析样本类型，围绕血浆蛋白质组学展开系统性刻画。该数据集由 KEITARO AKITA 于 2025 年发布，收录于 EBI（欧洲生物信息研究所）的 PRIDE 蛋白质组学数据平台，项目编号为 PXD060680。从主题构成看，该数据集同时关联肥厚型心肌病、血浆蛋白质组学、心血管系统疾病、蛋白质组与血浆等多个标签，属于心血管疾病分子层面研究的基础性数据资源，可为疾病机制探索、候选生物标志物发现以及蛋白质组学方法学研究提供公开可获取的数据支撑。
【数据集背景】
肥厚型心肌病是心血管系统疾病中具有代表性的心肌疾病类型，其分子层面的改变涉及多种蛋白质的表达与修饰变化。血浆作为与全身组织器官密切接触的体液样本，能够在一定程度上反映心脏及全身的病理生理状态，因此血浆蛋白质组学成为研究该类疾病的重要技术路径。该数据集正是在这一研究背景下产生，旨在通过对肥厚型心肌病患者血浆样本进行综合性蛋白质组学分析，形成可供同行参考与再利用的公开数据资源。数据集的发布也体现了蛋白质组学数据共享的趋势，使相关研究结果能够在原始数据层面接受检验与二次分析。
【数据内容】
该数据集的主题涵盖肥厚型心肌病、血浆蛋白质组学、心血管系统疾病、蛋白质组与血浆等方面，其核心内容为血浆样本的蛋白质组学 profiling 数据。关于样本数量、分组设计、鉴定到的蛋白质数目、定量结果以及差异表达分析等具体内容，源站未提供。数据集名称中的“Comprehensive”表明其定位为较为全面的血浆蛋白质组刻画，但具体覆盖范围需以源站记录为准。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，即欧洲生物信息研究所维护的公共数据平台，具体收录于 PRIDE 蛋白质组学档案库，项目访问编号为 PXD060680。数据由 KEITARO AKITA 于 2025 年提交发布。关于样本采集地点、采集时间、受试者来源、伦理审批信息以及仪器平台与实验流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位，该数据集可适用于肥厚型心肌病相关的基础与转化研究场景，包括血浆蛋白质组层面的疾病特征描述、候选生物标志物的筛选与验证思路构建，以及与其他心血管疾病蛋白质组数据集的比较分析。同时，该数据集也可用于蛋白质组学数据处理流程的方法学检验与复用练习。需要说明的是，上述适用方向系依据数据集主题所作的通用性说明，具体分析可行性应以源站提供的原始数据与元数据为准。
【使用方法】
该数据集通过 EBI 的 PRIDE 平台以项目编号 PXD060680 对外提供，使用者可依据该编号在平台上检索并获取数据集记录。关于数据下载方式、文件格式构成、原始质谱数据与搜索结果文件的组织方式，以及是否附带分析脚本或参数说明，源站未提供。使用前建议先查阅源站项目页面以确认可获取的文件类型与使用条件。
【质量与限制】
该数据集为公开收录的蛋白质组学数据集，其质量评估依赖于源站记录中的实验设计与数据处理信息。关于数据集的样本规模、技术重复、质控指标、缺失值情况以及潜在的批次效应等质量相关细节，源站未提供。使用者在开展二次分析时，应结合源站元数据自行评估数据适用性，并注意血浆蛋白质组数据在动态范围与个体差异方面的固有特点。
【引用与许可】
依据源站描述，该数据集的引用信息为：KEITARO AKITA (2025). Comprehensive Plasma Proteomics Profiling of Hypertrophic Cardiomyopathy [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060680。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供，使用者在引用与再利用时应以源站页面所载信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060680
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
KEITARO AKITA (2025). Comprehensive Plasma Proteomics Profiling of Hypertrophic Cardiomyopathy [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD060680
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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