心脏细肌丝靶向分子动力学与伞形采样输入文件

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A8084f46f6e4b37cd41e1573a3dc2ee57eaf2f3bf6788665876ca26d9d6cdc3f9

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

心肌细肌丝由F-肌动蛋白、原肌球蛋白和肌钙蛋白（cTn）组成。cTn由三个亚基构成：肌钙蛋白C（cTnC）、肌钙蛋白I（cTnI）和肌钙蛋白T（cTnT）。为通过计算研究细肌丝对cTn激活事件的影响，我们采用靶向分子动力学，随后使用细肌丝模型进行伞形采样，以测量cTn转变事件的热力学。我们的模拟揭示，细肌丝导致打开cTnC疏水 patch 所需的自由能增加，并使该区域与cTnI开关肽之间的相互作用更为有利。cTn复合物的突变可导致心肌病，这是一组临床表现为心肌肥厚或扩张的疾病，导致心脏正常功能受损，最终引起心肌梗死或心力衰竭。在将心肌病相关突变引入cTnI的R145后，我们……所提交的数据仅是用于运行心脏细肌丝所有靶向分子动力学和伞形采样模拟的起始文件。

文件由提交作者手动创建。.DCD和.PSF文件应使用能够读取数据的软件打开（如PyMOL、Chimera、Maestro等）。所有其他文件可用文本编辑器打开。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。