性别相关心律失常分子机制解析

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A370072b36d27b048b4f9889f26a89d146fc0b86b964d65aa522abc0c499dc929

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

女性已被证明是遗传性和获得性心律异常的独立危险因素，如长QT综合征（LQTS）及相关心律失常。值得注意的是，女性是药物诱导的获得性LQTS高达70%患病率的关键因素，然而，解释这一现象的基本分子机制尚不清楚。

既往实验和临床研究表明，这可能与性激素（雌二醇、孕酮和睾酮）水平差异有关，这些激素在致心律失常倾向中发挥相反作用，加剧或减轻突变或药物对心脏离子通道的影响。在美国心脏协会（AHA）资助的职业发展奖19CDA34770101“基于性别的心律失常分子机制阐明”中，我们重点关注激素与人Kv11.1钾通道（由hERG——人类Ether-à-go-go相关基因编码）的相互作用，该通道是心脏动作电位复极的主要贡献者……该数据集通过分子动力学（MD）模拟和基于片段的配体竞争饱和位点识别（SILCS）分子对接计算收集，所用野生型hERG钾通道模型基于冷冻电镜（cryo-EM结构），PDB ID：5VA2。模型中使用了孔道和电压传感域残基405-668。使用Rosetta结构建模进行缺失环的从头构建。

在约260个1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）脂质双分子层中，由0.15 M KCl水溶液浸泡的hERG通道模型，以及一个最初置于水溶液中的激素分子，在……条件下。所有模拟均使用NAMD 2.13或更高版本，在NPT系综中于310 K和1 atm压力下运行，采用Nose-Hoover恒温器和Langevin活塞恒压器。非键相互作用采用标准截断方案和粒子网格Ewald（PME）方法。采用标准CHARMM生物分子力场（脂质使用C36，蛋白质使用CHARMM36m）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。