心力衰竭人类骨骼肌转录组学分析

该数据集来自 EBI Expression Atlas,为差异表达实验,物种为 Homo sapiens,内容是对心力衰竭人类骨骼肌的转录组学分析

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基因组分类Differential
E-MTAB-8531: Transcriptomics analysis of skeletal muscle in humans with heart failure

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

心力衰竭人类骨骼肌转录组学分析

E-MTAB-8531 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,英文全称为 Transcriptomics analysis of skeletal muscle in humans with heart failure,中文可译为“心力衰竭人类骨骼肌转录组学分析”。该数据集以 Homo sapiens(人类)为研究对象,聚焦心力衰竭这一循环系统疾病背景下骨骼肌组织的转录组变化,通过差异表达分析揭示基因表达层面的改变。数据集来源站为 ebi.ac.uk,主题标签为 Differential,属于表达谱类实验数据,适合用于探索心力衰竭对骨骼肌基因表达的影响及相关分子机制研究。

【数据集背景】

心力衰竭是循环系统疾病中的重要类型,除心脏本身的功能障碍外,常伴随骨骼肌等外周组织的代谢与功能异常。E-MTAB-8531 正是针对这一背景开展的研究数据,其核心内容是对心力衰竭人类骨骼肌进行转录组学分析。该数据集归属于循环系统疾病 / 心力衰竭分类,来源于 EBI Expression Atlas,属于差异表达(Differential)实验类型,物种为 Homo sapiens。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),说明其定位是表达图谱中的差异表达实验记录,而非原始测序数据归档。

【数据内容】

该数据集的主题为人类心力衰竭骨骼肌的转录组学分析,实验类型为差异表达实验。其内容围绕骨骼肌组织在心力衰竭状态下的基因表达差异展开,属于转录组层面的表达谱数据。源站描述明确其物种为 Homo sapiens,实验类型为 Differential。关于具体样本数量、分组设计、检测平台、基因数量及差异表达基因列表等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即 EBI Expression Atlas 实验记录,源站描述为 Expression Atlas experiment (Differential)。数据物种为 Homo sapiens,研究组织为骨骼肌,研究背景为人类心力衰竭。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心力衰竭相关的基础与转化研究,尤其是关注骨骼肌转录组改变的场景。可用于差异表达结果的查询与验证、心力衰竭骨骼肌基因表达模式的比较分析,以及作为表达图谱资源支持转录组层面的假设生成。由于其主题标签为 Differential,适合用于差异表达分析相关的教学、方法比较与结果参照。关于具体疾病亚型、人群特征或临床分层信息,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 EBI Expression Atlas 平台访问,属于 Expression Atlas experiment (Differential) 记录。使用者可依据源站提供的实验标识 E-MTAB-8531 进行检索与浏览。关于数据下载格式、分析工具接口、差异表达阈值设置及可视化方式,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI Expression Atlas 收录的差异表达实验记录,物种与组织信息明确。其限制在于,源站描述较为简要,未提供样本量、平台细节、统计方法及差异表达基因清单等具体信息,使用时应结合源站原始记录核实。关于数据质量评估指标与批次效应等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,标识为 E-MTAB-8531。关于引用方式、许可协议及使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8531

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptomics analysis of skeletal muscle in humans with heart failure

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