压力诱导肥厚心脏的人类细胞图谱

数据集获取

源站：https://data.humancellatlas.org/explore/projects/902dc043-7091-445c-9442-d72e163b9879

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病理性心脏肥大是心力衰竭的主要原因，但关于人类肥厚心脏中心脏细胞的全套细胞类型及其基因表达谱的知识仍然缺失。在此，我们利用大规模单核转录组学，呈现了人心肌细胞对主动脉瓣狭窄所致压力超负荷的转录反应，并描述了心脏细胞间通讯的重大改变。肥大的心肌细胞来自内皮细胞和成纤维细胞的输入减少。编码Eph受体酪氨酸激酶的基因，尤其是EPHB1，在肥厚心脏的心肌细胞中显著下调。因此，由主要由内皮细胞表达的其配体ephrin (EFN)B2对EPHB1的激活减少。EFNB2在体外抑制心肌细胞肥大，而在内皮细胞中沉默其表达可在共培养的心肌细胞中诱导肥大。我们的肥厚心脏人类细胞图谱强调了细胞间通讯在疾病发病机制中的重要性，并提供了宝贵的资源。器官：心脏。人类细胞图谱计划（单细胞）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。