通过生物信息学方法分析扩张型心肌病的基因表达谱

该数据集包含扩张型心肌病(DCM)的基因表达谱数据,数据模态为基因表达矩阵,涵盖15个正常样本和13个DCM样本。研究通过生物信息学方法识别了4777个差异表达基因,进行了通路富集分析,并预测了潜在的转录因子、microRNA调控因子及小分子药物,主要用于扩张型心肌病的分子机制探索和药物靶点预测研究。

Figshare
2016-10-01 更新
扩张型心肌病分子机制心血管药物靶点预测
创建时间2016-10-01
更新时间2016-10-01
原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Analyzing_gene_expression_profiles_in_dilated_cardiomyopathy_via_bioinformatics_methods/7898762

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资源简介

该数据集是一个针对扩张型心肌病(DCM)的基因表达谱研究数据集。数据集包含从基因表达综合数据库下载的GSE3586基因表达谱数据,包括15个正常样本和13个DCM样本。研究通过R语言的Limma包识别了正常与DCM样本之间的差异表达基因,并进行了通路富集分析。同时预测了这些差异表达基因的潜在转录因子和microRNA调控因子,并映射到cMap数据库以寻找潜在的小分子药物。数据集共识别出4777个差异表达基因,富集于26条通路中,包括淋巴细胞TarBase通路和雄激素受体信号通路等。该数据集主要用于扩张型心肌病的分子机制研究、药物靶点预测和生物标志物发现。

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