通过生物信息学方法分析扩张型心肌病的基因表达谱

该数据集包含扩张型心肌病(DCM)的基因表达谱数据,数据模态为基因表达矩阵,涵盖15个正常样本和13个DCM样本。研究通过生物信息学方法识别了4777个差异表达基因,进行了通路富集分析,并预测了潜在的转录因子、microRNA调控因子及小分子药物,主要用于扩张型心肌病的分子机制探索和药物靶点预测研究。

Figshare
2016-10-01 更新
浏览 28
Dilated cardiomyopathyDifferentially expressed genesPathway enrichment analysisTranscription factorsmicroRNAsSmall molecules
Analyzing Gene Expression Profiles in Dilated Cardiomyopathy via Bioinformatics Methods

基本信息

大小
0.000354871 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-10-01
版本
v1

资源简介

通过生物信息学方法分析扩张型心肌病的基因表达谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Analyzing gene expression profiles in dilated cardiomyopathy via bioinformatics methods》。配套论文《Analyzing gene expression profiles in dilated cardiomyopathy via bioinformatics methods》发表于 Brazilian Journal of Medical and Biological Research(2016),DOI:10.1590/1414-431x20164897。源站首次发布:2019-03-27。

【数据内容】

源站原始描述:Dilated cardiomyopathy (DCM) is characterized by ventricular dilatation, and it is a common cause of heart failure and cardiac transplantation. This study aimed to explore potential DCM-related genes and their underlying regulatory mechanism using methods of bioinformatics. The gene expression profiles of GSE3586 were downloaded from Gene Expression Omnibus database, including 15 normal samples and 13 DCM samples. The differentially expressed genes (DEGs) were identified between normal and DCM s…

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 354.87 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.7898762.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology not elsewhere classified。主题标签:Dilated cardiomyopathy、Differentially expressed genes、Pathway enrichment analysis、Transcription factors、microRNAs、Small molecules。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Analyzing_gene_expression_profiles_in_dilated_cardiomyopathy_via_bioinformatics_methods/7898762

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, Liming; Zhu, L.; Luan, R.; Wang, L.; Fu, J.; Wang, X.; et al. (2016). Analyzing gene expression profiles in dilated cardiomyopathy via bioinformatics methods. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/Analyzing_gene_expression_profiles_in_dilated_cardiomyopathy_via_bioinformatics_methods/7898762

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数据说明

该数据集是一个针对扩张型心肌病(DCM)的基因表达谱研究数据集。数据集包含从基因表达综合数据库下载的GSE3586基因表达谱数据,包括15个正常样本和13个DCM样本。研究通过R语言的Limma包识别了正常与DCM样本之间的差异表达基因,并进行了通路富集分析。同时预测了这些差异表达基因的潜在转录因子和microRNA调控因子,并映射到cMap数据库以寻找潜在的小分子药物。数据集共识别出4777个差异表达基因,富集于26条通路中,包括淋巴细胞TarBase通路和雄激素受体信号通路等。该数据集主要用于扩张型心肌病的分子机制研究、药物靶点预测和生物标志物发现。

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