鼻咽癌关键基因识别数据集
该数据集是一个基于GSE12452微阵列数据的基因表达数据集,包含31个鼻咽癌样本和10个正常组织的基因表达谱,通过差异表达分析识别出487个差异表达基因,并利用生物信息学工具进行了功能和通路富集分析及调控网络构建,主要用于研究鼻咽癌的关键基因、分子机制及潜在生物标志物,为鼻咽癌的病因研究和治疗靶点发现提供数据基础。

基本信息
资源简介
鼻咽癌关键基因识别数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma》。配套论文《Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma》发表于 Brazilian Journal of Otorhinolaryngology(2017),DOI:10.1016/j.bjorl.2016.09.003。源站首次发布:2017-12-20。
【数据内容】
源站原始描述:Abstract Introduction: Nasopharyngeal carcinoma is the most common cancer originating from the nasopharynx. Objective: To study the mechanisms of nasopharyngeal carcinoma, we analyzed GSE12452 microarray data. Methods: GSE12452 was downloaded from the Gene Expression Omnibus database and included 31 nasopharyngeal carcinoma samples and 10 normal nasopharyngeal tissue samples. The differentially expressed genes were screened by ANOVA in the PGS package. Using the BiNGO plugin in Cytoscape and pat…
【数据结构与技术规格】
文件数 6 个,合计 2.90 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.5720251.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Otorhinolaryngology。主题标签:Nasopharyngeal carcinoma、Differentially expressed genes、Enrichment analysis、Regulatory network。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Otorhinolaryngology。
【获取与许可】
源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_key_genes_involved_in_nasopharyngeal_carcinoma/5720251
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Jiang, Xue; Feng, Lichun; Dai, Baoqiang; Li, Liping; Lu, Weiwei (2017). Identification of key genes involved in nasopharyngeal carcinoma. SciELO journals. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-02-29,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个用于研究鼻咽癌(NPC)关键基因的基因表达数据集。它基于GEO数据库中的GSE12452微阵列数据,包含31个鼻咽癌样本和10个正常鼻咽组织样本。通过对差异表达基因(DEGs)进行筛选,共识别出487个差异表达基因。研究进一步利用Cytoscape软件中的BiNGO插件和PGS包进行功能和通路富集分析,并构建了转录因子-差异表达基因调控网络,以预测关键基因的潜在功能。主要研究方向包括鼻咽癌的分子机制探索、关键生物标志物发现以及基因调控网络分析,为鼻咽癌的发病机理研究和潜在治疗靶点识别提供数据支持。
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