DNA结合剂对EWS-FLI1结合差异破坏的研究数据集
该数据集包含通过生化与细胞实验获得的化合物筛选数据,主要模态为实验测量数据(如结合亲和力、基因表达水平),研究了多种DNA结合剂(特别是放线菌素D)对尤文肉瘤关键致癌蛋白EWS-FLI1与其DNA靶点结合能力的差异破坏效应,旨在探索转录因子选择性抑制的分子机制,并为尤文肉瘤的靶向治疗策略提供潜在的药物筛选与机制研究基础。

基本信息
资源简介
DNA结合剂对EWS-FLI1结合差异破坏的研究数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Differential Disruption of EWS-FLI1 Binding by DNA-Binding Agents》。配套论文《Differential Disruption of EWS-FLI1 Binding by DNA-Binding Agents》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0069714。源站首次发布:2013-07-22。
【数据内容】
源站原始描述:Fusion of the EWS gene to FLI1 produces a fusion oncoprotein that drives an aberrant gene expression program responsible for the development of Ewing sarcoma. We used a homogenous proximity assay to screen for compounds that disrupt the binding of EWS-FLI1 to its cognate DNA targets. A number of DNA-binding chemotherapeutic agents were found to non-specifically disrupt protein binding to DNA. In contrast, actinomycin D was found to preferentially disrupt EWS-FLI1 binding by comparison to p53 bin…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个,合计 854.65 KB。Figure_S1.tif:image/tiff,405.43 KB。Figure_S2.tif:image/tiff,402.63 KB。Table_S1.doc:application/msword,46.59 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0069714。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Chemistry、Biological Sciences。主题标签:Biochemistry、proteins、DNA-binding proteins、chemical biology、drug discovery、Small molecules、biotechnology、organic chemistry、Organic compounds、Drugs and devices。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Chemistry、Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Differential_Disruption_of_EWS_FLI1_Binding_by_DNA_Binding_Agents_/750008
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Chen, Changmin; R. Wonsey, Diane; E. Lemieux, Madeleine; L. Kung, Andrew (2016). Differential Disruption of EWS-FLI1 Binding by DNA-Binding Agents. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集源于一项针对尤文肉瘤(Ewing sarcoma)致病关键因子EWS-FLI1融合癌蛋白的研究。数据集包含通过均相邻近分析筛选出的、能够破坏EWS-FLI1与其DNA靶点结合的化合物数据,特别聚焦于DNA结合类化疗药物。研究发现,放线菌素D(actinomycin D)在体外和细胞实验中,相较于其他转录因子(如p53),能优先破坏EWS-FLI1与染色质的结合,并抑制其介导的基因表达程序。数据揭示了特定浓度下药物对转录因子结合的选择性干扰效应,为理解DNA结合剂的靶向机制及筛选能选择性破坏特定转录因子亚类的化合物提供了实验依据。主要研究方向包括转录因子靶向抑制、尤文肉瘤的药物发现与机制研究。
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