多族裔样本二代测序2型糖尿病遗传探索（T2D-GENES）随访研究：Framingham心脏研究

数据集获取

源站：https://doi.org/10.60645/bdc-3175-16us

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数据说明

本子研究 phs001610 Framingham T2D-GENES 包含多民族样本中的下一代测序数据。Framingham 队列研究参与者的汇总水平表型可在顶级研究页面 phs000007 Framingham 队列查看。所有 Framingham 顶级研究及子研究的个体水平表型数据和分子数据可通过申请 Framingham 队列研究 phs000007 的授权访问获取。约 52,000 样本的 2 型糖尿病外显子组测序项目是由六个联盟合作开展，这些联盟拥有不同的资助机制，共同利用迄今汇编的最大 T2D 病例/对照样本集来研究 2 型糖尿病（T2D）的遗传变异。

样本来源包括：- 多民族样本二代测序2型糖尿病遗传探索项目（T2D-GENES）- 2型糖尿病遗传学项目（GoT2D）- 外显子组测序项目（ESP）- 美洲基因组医学精简计划（SIGMA）- 隆德贝克基金会个性化疾病预测、预防与护理应用医学基因组学中心（LuCAMP）- 青少年糖尿病遗传学进展项目（ProDIGY）来自Framingham心脏研究（FHS）队列的数据是T2D-GENES（多民族样本二代测序2型糖尿病遗传探索项目）联盟的一部分，该联盟是由NIDDK资助的国际研究联盟，旨在通过多民族测序研究识别2型糖尿病（T2D）的遗传变异。T2D-GENES项目是一项多民族测序研究，旨在评估较少见变异是否在T2D风险中发挥作用，并评估不同祖先群体中T2D风险变异分布的相似性和差异性。个体来自表1所列6个联盟的20多个队列。

该策略是对个体进行深度外显子组测序，其中24,991人患有2型糖尿病。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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