TSC生物样本库与自然史数据库

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05676099

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：结节性硬化症、淋巴管肌瘤病。该项目由TSC Alliance赞助，旨在加深对结节性硬化症复合体（TSC）的了解，从而可能为影响身体不同部位（如脑、肾、心脏、肺和皮肤）的疾病带来新的治疗方法。TSC Alliance TSC生物样本库（BSR）的建立是为了在密歇根州大急流城的Van Andel研究所（VAI）生物样本库提供一个中心生物样本库，用于收集大量TSC患者的血液、组织和细胞。TSC Alliance自然史数据库（NHD）成立于2006年，将作为中心数据库，保存与从TSC患者收集的生物样本相关的去标识化临床数据。NHD研究项目涉及收集被诊断为TSC的个体在其一生中的回顾性和前瞻性私人信息（即纵向研究）。VAI生物样本库将根据TSC Alliance的批准向研究人员分发生物样本和NHD数据。

本项目还旨在收集散发性淋巴管肌瘤病（散发性LAM）患者的生物样本和临床数据。LAM是TSC中常见的一种症状，也可能出现在未诊断为TSC的背景下（即散发性LAM患者）。生物样本的采集将在临床研究站点（CSS）进行，例如TSC联盟认可的TSC诊所；也可在非CSS场所进行，例如参与者家中、教育会议，或由其他临床合作伙伴（CP）在获得本方案机构审查委员会（IRB）批准及知情同意书的情况下进行。生物样本采集也可在非CSS场所进行，或由持证采血员完成（例如通过与移动采血公司合作）。VAI生物样本库将向CSS、非CSS、CP或直接向参与者提供采集套件、说明和材料。CSS、CP、非CSS或授权代表将把采集到的生物样本运送至VAI生物样本库，以便根据……进行处理和储存。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。