抑郁症对冠心病发病率及危险因素性别特异性影响的多组学补充数据集
主题标签：抑郁症、冠心病、性别特异性、GWAS、多组学、PRS、UK Biobank。本站分类：循环系统疾病/其他。本数据集为循环系统疾病领域公开数据集，由Zenodo提供，主题涵盖抑郁症。
基本信息
资源简介
抑郁症对冠心病发病率及危险因素性别特异性影响的多组学补充数据集
该数据集为一项关于抑郁症对冠心病发病及风险因素性别特异性影响的多组学研究补充数据，英文全称为“Sex-specific effects of depression on the incidence and risk factors for coronary heart disease: insights from multi-omics approaches—Supplement dataset”。数据集由Haozhang, Huang提交至Zenodo平台，发布时间为2026年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议。在本站分类中，该数据集归入循环系统疾病/其他类别，主题标签涵盖抑郁症、冠心病、性别特异性、GWAS、多组学、PRS及UK Biobank等关键词。数据集围绕抑郁症与冠心病之间的性别差异展开，整合了性别分层全基因组关联分析（GWAS）数据与多基因风险评分（PRS）计算流程，为探索抑郁症影响冠心病发病的性别特异性机制提供数据支撑，适用于循环系统疾病领域的遗传流行病学与多组学研究。
【数据集背景】
抑郁症与冠心病之间的关联存在显著的性别差异，但相关遗传机制尚待深入解析。该数据集来源于一项采用多组学方法探讨抑郁症对冠心病发病及风险因素性别特异性影响的研究，旨在通过性别分层的遗传数据分析，揭示抑郁症与冠心病之间性别差异的遗传基础。研究依托多个国际大型队列的GWAS汇总数据，结合多基因风险评分方法，构建了可用于性别特异性分析的补充数据集。
【数据内容】
数据集的核心内容包含两大部分：一是抑郁症的性别特异性GWAS数据，二是冠心病的GWAS数据。抑郁症GWAS基于五个国际队列开展，包括澳大利亚抑郁症遗传学研究、BIObanks Netherlands Internet Collaboration、焦虑与抑郁遗传关联研究、UK Biobank以及All Of Us研究，共涉及女性病例130,471例与对照159,521例，男性病例64,805例与对照132,185例。冠心病GWAS数据来源于Neale Lab与UK Biobank的性别分层GWAS数据集，以及CARDIoGRAMplusC4D联盟的混合性别结局数据。此外，数据集还涉及基于PRSice计算的多基因风险评分结果，覆盖多个P值阈值。
【采集与来源】
数据来源站为doi.org。抑郁症GWAS数据整合自五个国际队列，相关研究发表于https://doi.org/10.1038/s41467-025-63236-1。冠心病GWAS数据来源于Neale Lab与UK Biobank性别分层GWAS数据集（http://www.nealelab.is/uk-biobank/），混合性别结局数据来自CARDIoGRAMplusC4D联盟（https://doi.org/10.1038/ng.3396）。数据集由Zenodo平台提供，作者为Haozhang, Huang。
【适用场景】
该数据集适用于抑郁症与冠心病共病机制的性别特异性遗传研究，可用于性别分层GWAS分析、多基因风险评分构建与验证、抑郁症与冠心病遗传重叠的探索，以及多组学整合分析等场景。主题标签涵盖抑郁症、冠心病、性别特异性、GWAS、多组学、PRS与UK Biobank，适合循环系统疾病领域的遗传流行病学研究者使用。
【使用方法】
多基因风险评分采用PRSice计算，该R脚本基于PLINK v2.0在多个P值阈值下计算PRS，参数设置为r2 < 0.1、kb窗口 = 250 kb，P值阈值包括5E-8、1E-5、0.001、0.005、0.01、0.05、0.1、0.5、1。源站描述中关于最佳P值阈值（Best PT threshold）的内容未完整提供，源站未提供该部分完整信息。
【质量与限制】
数据集依托UK Biobank、All Of Us、CARDIoGRAMplusC4D等国际大型队列与联盟的GWAS汇总数据，样本量较大，覆盖女性与男性病例及对照。源站未提供关于数据质量控制、批次效应、人群 ancestry 构成及验证策略的进一步信息。使用者应注意GWAS汇总数据的群体特异性与性别分层样本的不均衡性可能对结果解释产生影响，具体限制说明源站未提供。
【引用与许可】
数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议，使用时需注明作者Haozhang, Huang及Zenodo来源。相关研究引用可参考抑郁症GWAS对应的https://doi.org/10.1038/s41467-025-63236-1以及冠心病GWAS对应的https://doi.org/10.1038/ng.3396。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.20374325
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 4.19 GB。
数据说明
1）抑郁症的性别特异性GWAS使用来自五个国际队列的数据进行，包括130，471例女性病例和159，521例对照，以及64，805例男性病例和132，185例对照。这些队列包括澳大利亚抑郁症遗传学研究、BIObanks Netherlands Internet Collaboration、焦虑与抑郁遗传关联研究、UK Biobank和All Of Us研究（https://doi.org/10.1038/s41467-025-63236-1）。2）CHD的GWAS数据来源于Neale Lab和UK Biobank性别分层GWAS数据集（http://www.nealelab.is/uk-biobank/），以及CARDIoGRAMplusC4D联盟的混合性别结局数据（https://doi.org/10.1038/ng.3396）。3）PRS使用PRSice计算，该R脚本通过PLINK v2.0在多个P值阈值下计算PRS（r2 < 0.1；kb窗口 = 250 kb；PT < 5E-8、1E-5、0.001、0.005、0.01、0.05、0.1、0.5、1）。对于现患和 incident 抑郁事件，PRS的最佳PT阈值为0.05。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
