UK Biobank 伤害性肌肉骨骼疼痛治疗反应全基因组关联研究数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17026/DANS-XNS-UN6C

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数据说明

痛觉性肌肉骨骼疼痛（NMP）的药物治疗遵循三步镇痛阶梯方案，从非甾体抗炎药（NSAIDs）开始，随后使用弱阿片类药物或强阿片类药物，直至疼痛得到控制。在此，我们利用英国生物银行（UK Biobank）的数据，开展了一项全基因组关联研究（GWAS），以二分类表型比较NSAID使用者和阿片类药物使用者，作为NSAID治疗反应的替代指标。我们旨在寻找一般人群中与疼痛治疗反应相关的常见遗传变异。本存储库中上传的数据类型：英国生物银行是一个大型生物医学数据库和研究资源，包含来自50万英国参与者的深入遗传和健康信息（https://www.ukbiobank.ac.uk/）。该数据库向经批准开展最常见及危及生命疾病重要研究的研究人员全球开放。由于原始数据规模庞大且仅可通过向UKB申请获取，我们仅提供分析结果，相关描述亦见于此：medrxiv，目前正在某科学期刊修订中。

在该数据集中，您将发现9，435，994个SNP遗传变异与疼痛治疗反应（PTR）表型的关联。该数据集不适用于用Excel打开，最好在集群计算机上或使用特定软件打开。研究对象英国生物银行是一个普通人群队列，招募了来自英国（UK）各地超过50万名年龄在40–69岁之间的参与者。我们利用最新发布的初级保健（全科医生，GP）数据——该数据包含纵向结构化诊断和处方数据——构建了一个表型，作为NSAIDs疼痛治疗反应的替代指标。为了定义PTR表型，我们首先从GP数据中提取了所有伤害性肌肉骨骼疼痛（NMP）的治疗和诊断。NMP诊断主要选自肌肉骨骼和结缔组织疾病章节及相关症状或

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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